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yysj0802

银虫 (小有名气)

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[求助] 高性能计算提交abaqus的job问题

各位虫友你们好，鄙人最近想使用学校的高性能计算中心的abaqus（需要调用自编的用户子程序vumat），但是不知道如何修改abaqus.pbs脚本文件，请熟悉这问题的虫友指点一二，谢谢，谢谢。
PS：以下是abaqus.pbs脚本的代码：
#!/bin/sh
#################################################################
#PBS -N Abaqus
#PBS -l nodes=2:ppn=16
#PBS -l walltime=4:00:00
#PBS -q batch
#PBS -V
#PBS -S /bin/bash
#################################################################

EXEC=/export/software/abaqus/Commands/abaqus

##To be modified by users##
ARGS="beam"

cd $PBS_O_WORKDIR

NP=`cat $PBS_NODEFILE | wc -l`
cat $PBS_NODEFILE > /tmp/nodefile.$$
sed -e 's\c\ibc\g' -i /tmp/nodefile.$$
#$PARA -genv I_MPI_DEVICE ssm -hostfile /tmp/nodefile.$$ -np $NP $EXEC $ARGS

mp_host_list="["
for n in $(sort -u $PBS_NODEFILE);do
mp_host_list="${mp_host_list}['$n',$(grep -c $n $PBS_NODEFILE)],"
done
mp_host_list=$(echo ${mp_host_list} | sed -e "s/,$/]/"

cat > abaqus_v6.env<<'EOF'
ask_delete=OFF
EOF
echo "mp_host_list=${mp_host_list}" >> abaqus_v6.env

# Run the job
#$EXEC mp_mode=threads cpus=$NP job=$ARGS input=$ARGS.inp
$EXEC mp_mode=mpi cpus=$NP job=$ARGS input=$ARGS.inp interactive

#del tmp files
rm -rf /tmp/nodefile.$$

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