应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 专业学科区 » 农林 » 植保 » 热图--聚类分析
51/1返回列表
查看: 2926  |  回复: 13
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

山脚下的喵

新虫 (小有名气)

[交流] 热图--聚类分析

最近在看文献时，遇到了疑问。

请问大家在做聚类分析的时候，所有的基因组应该是一起测定的么，如果用了下载的转录组，那还有比较的意义么？
下图是文章里的，只有Vm和Vp是文章中自己测定的转录组，另外12个是别的真菌里的。我没在文章中看到这12个真菌是从哪里下载的，所以有点疑问。里面用到了SMURF把次生代谢基因和基因簇识别出来，用tribeMCL 把蛋白组聚集成家族。表示自己不会用，不知道这些会比对到别的真菌中相应蛋白的表达量么？

有点啰嗦，先谢谢大家~~

热图--聚类分析
图片1.png
回复此楼

» 猜你喜欢

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2016-12-02 11:25:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

高亚茹

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
请问有大神使用过SMURF吗？
赞一下 回复此楼
14楼2020-01-01 16:42:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 14 个回答

君恋多

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
这个图是不同真菌基因组细胞壁降解蛋白的比较，并没有涉及到转录组。网上下载的转录组也可以比较，但是必须是在相同的条件下。

发自小木虫Android客户端
赞一下(1人) 回复此楼
12楼2016-12-02 13:57:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ZLQJIAYOU

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
每一行表示基因，左右两侧都是基因名吗？

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
13楼2019-11-24 10:16:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 14 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭