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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 用MS做完分子动力学模拟后，怎么根据结果做出像文献中一样的径向分布图
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mupchy

金虫 (正式写手)

[求助] 用MS做完分子动力学模拟后，怎么根据结果做出像文献中一样的径向分布图 已有1人参与

如题，菜鸟好不容易磕磕绊绊的用MS做完了分子动力学模拟后，对于怎么做出像文献中那样的径向分布图没有一点头绪，网上查了很多，还是不会，求哪位大神指点一下，能给出详细步骤就更好了！！谢谢大家啊！！！！

用MS做完分子动力学模拟后，怎么根据结果做出像文献中一样的径向分布图
文献中漂亮的图.jpg@smutao@oxox6085
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1楼 2016-11-30 22:22:52
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mupchy

金虫 (正式写手)
自己顶一下！！
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2楼2016-12-01 08:49:25
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Ronny_chou

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
首先做一个Forceit的电子密度计算，然后用analysis里的RDF进行切面分析就可以~
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3楼2016-12-01 09:00:24
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Ronny_chou

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

只要做过Forceit计算，选中.xsd或者.xtd文件，都可以分析

具体过程为：

选中其中三个原子（三原子确定一个面），然后做slice切面，最后Forceit analysis中RDF研究
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4楼2016-12-01 09:04:32
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mupchy

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by Ronny_chou at 2016-12-01 09:04:32
只要做过Forceit计算，选中.xsd或者.xtd文件，都可以分析

具体过程为：

选中其中三个原子（三原子确定一个面），然后做slice切面，最后Forceit analysis中RDF研究

您好！非常感谢您的回复，我通过view--->toolbars--->volume visualization, 发现可以调出creat slices，但是我这个模块整个是灰色的，无法操作，我在我的.xtd文件中各种角度选了三个原子，这个模块还是灰色的，无法操作，请问我哪里做错了吗？（Ps: 我用的是MS 7.0，我是用Discover模块做的动力学模拟。）
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5楼2016-12-01 09:42:45
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fxpckut215
祝福
6楼2016-12-01 10:03:02
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mupchy

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by Ronny_chou at 2016-12-01 09:04:32
只要做过Forceit计算，选中.xsd或者.xtd文件，都可以分析

具体过程为：

选中其中三个原子（三原子确定一个面），然后做slice切面，最后Forceit analysis中RDF研究

还有一个问题我没说明白，我想做出的是图中最左边的那种线状图！！不好意思啊，您告诉我的方法是不是得到中间的那种图的方法啊···
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7楼2016-12-01 10:27:56
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Ronny_chou

木虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by mupchy at 2016-12-01 10:27:56
还有一个问题我没说明白，我想做出的是图中最左边的那种线状图！！不好意思啊，您告诉我的方法是不是得到中间的那种图的方法啊···...

嗯嗯，我也是新手~左边的图应该是编辑后得到的图，看横纵坐标感觉是电子数梯度与距离的关系啊，你考虑下
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8楼2016-12-01 19:23:32
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