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548446557

金虫 (正式写手)

[求助] 如何确定NEB计算是否成功 已有1人参与

如何判断NEB计算是否收敛，是不是01,02...等文件夹中的OUTCAR得收敛才行？按照教程查看nebef.pl，得到图1，nebbarrier.pl得到neb.dat文件，cat neb.dat得到图2，nebresults.pl得到图3，有一堆乱七八糟东西了，接着卡主了，重启后发现文件如图4，但是mep.eps里面乱七八糟，不知道如何做成origin能垒图，求教如何判断NEB收敛，另外，如果没有收敛，怎么接着算，发现每个CONCAR文件中下面一堆NaN，不知道是啥意思，将CONCAR改成POSCAR能接着算吗？

如何确定NEB计算是否成功
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如何确定NEB计算是否成功-1
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如何确定NEB计算是否成功-2
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如何确定NEB计算是否成功-3
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1楼 2016-11-30 07:44:50
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548446557

金虫 (正式写手)
顶
2楼2016-12-01 08:57:49
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548446557

金虫 (正式写手)
顶
3楼2016-12-03 03:18:02
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548446557

金虫 (正式写手)
顶
4楼2016-12-03 03:18:10
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小熊尼尼

木虫 (正式写手)
楼主您能给我发一份NEB教程吗？非常感谢
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5楼2016-12-28 16:31:33
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周先森回家了

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
548446557(蛋蛋小童鞋代发): 金币+5, 谢谢参与，小木虫鼓励积极回答问题者 2016-12-29 16:36:14
做过渡态计算。首先要保证达到收敛，即slurm或者runlog中显示reached required accuracy ,收敛之后需要做一个频率分析来进行验证找到的过渡态是否是真正的过渡态，只有一个虚频的话，说明是。你的eps文件打开时乱七八糟的东西，估计是你打开的方式不对吧，应该是能垒与坐标的曲线图才对。
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尽自己最大的努力朝着正确的方向去做，远离拖延症~（2016-12-12）
6楼2016-12-29 14:22:26
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548446557

金虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 小熊尼尼 at 2016-12-28 01:31:33
楼主您能给我发一份NEB教程吗？非常感谢

就是一个博客上的教程，一搜就能看到

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7楼2016-12-29 15:01:38
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548446557

金虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 周先森回家了 at 2016-12-28 23:22:26
做过渡态计算。首先要保证达到收敛，即slurm或者runlog中显示reached required accuracy ,收敛之后需要做一个频率分析来进行验证找到的过渡态是否是真正的过渡态，只有一个虚频的话，说明是。你的eps文件打开时乱七 ...

频率分析是怎么得到的？有教程吗？

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8楼2016-12-29 15:40:45
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小熊尼尼

木虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 548446557 at 2016-12-29 15:01:38
就是一个博客上的教程，一搜就能看到
...

谢谢
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9楼2016-12-29 16:34:23
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周先森回家了

金虫 (著名写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 548446557 at 2016-12-29 15:40:45
频率分析是怎么得到的？有教程吗？
...

NSW=1 IBRION=5 POTIM=0.01-0.02
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尽自己最大的努力朝着正确的方向去做，远离拖延症~（2016-12-12）
10楼2016-12-29 16:48:20
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