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huahua1216

至尊木虫 (文坛精英)

[交流] 结晶的分子无序 求教高手 嘿嘿 红包给大家喝茶 辛苦了都

RT 又是间甲基苯甲酸的一个晶体 其余地方都还好 就是一个游离的东东不知道是啥 俺初步判断是间甲基苯甲酸分子 可是无序的样子忒恐怖 单胞又是只显示一半  俺搞不定 期待高手 呵呵

xi2004  级数收敛。。。。。。。大家帮忙啊
小小红包大家喝茶
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级数收敛

★ ★ ★ ★ ★
huahua1216(金币+4,VIP+0):就是说read的话那一堆东西只出现一半 而且有的原子像是重叠的 我不知道怎么用part命令 呵呵
waiy2001(金币+1,VIP+0):谢谢参与讨论
不是已经推测得很合理了么?直接命名之后写到ins里面就可以了啊
ps,什么是单胞
引用回帖:
Originally posted by huahua1216 at 2008-12-4 21:44:
[box=white]RT 又是间甲基苯甲酸的一个晶体 其余地方都还好 就是一个游离的东东不知道是啥 俺初步判断是间甲基苯甲酸分子 可是无序的样子忒恐怖 单胞又是只显示一半  俺搞不定 期待高手 呵 ...

2楼2008-12-04 22:22:42
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huahua1216

至尊木虫 (文坛精英)

引用回帖:
Originally posted by 级数收敛 at 2008-12-4 22:22:
不是已经推测得很合理了么?直接命名之后写到ins里面就可以了啊
ps,什么是单胞

就是说read的话那一堆东西只出现一半 而且有的原子像是重叠的 我不知道怎么用part命令 呵呵
3楼2008-12-05 08:24:57
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级数收敛

★ ★ ★ ★ ★ ★
warlen(金币+1,VIP+0):3Q~
huahua1216(金币+5,VIP+0):小小红包 喝茶~~(*^__^*)
好像一个分子是另一个分子通过一个反演中心对称出来的
如果只出一半,应该是出现一个完整的分子
引用回帖:
Originally posted by huahua1216 at 2008-12-5 08:24:

就是说read的话那一堆东西只出现一半 而且有的原子像是重叠的 我不知道怎么用part命令 呵呵

4楼2008-12-05 09:52:54
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etongtong

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★
warlen(金币+1,VIP+0):3Q~
huahua1216(金币+3,VIP+0):小小红包 喝茶~~(*^__^*)
ins文件:
FVAR       0.11344   0.50000

PART 1
C13A  1    0.440412    1.342682    0.107947    21.00000    0.04071    0.04595 =
         0.08781   -0.03921    0.00854    0.00640
PART 2
C13B  1    0.440475    1.309546    0.125832   -21.00000    0.03099    0.02988 =
         0.04538   -0.01776    0.02015   -0.00523
PART 0
照着写, 把原子坐标改成你的.
一个一个的输入.
▄︻┻┳═一................................................
5楼2008-12-05 10:00:04
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xiesanshao

木虫 (正式写手)

出来混,迟早要还的!记住!

★ ★ ★ ★
warlen(金币+1,VIP+0):3Q~
huahua1216(金币+3,VIP+0):小小红包 喝茶~~(*^__^*)
这个无序有些复杂楼主的选择:
1:找个高手给你解
2:找那本crystal structure refinement书看,论坛上有电子版,上面无序一章有关于一个类似的苯甲基的无序,学习下同理可以解决!
教一下子很难教会!
天空的心,随风漂流!
6楼2008-12-05 11:16:39
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zds316

木虫 (著名写手)


huahua1216(金币+1,VIP+0):呵呵 对头
还是高手解说比较好,每次遇见无序头都大了,痛苦
http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=3133586
7楼2008-12-09 18:38:09
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级数收敛

祝小木虫越来越好

[ Last edited by 级数收敛 on 2008-12-12 at 19:32 ]
8楼2008-12-12 18:14:46
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级数收敛

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
warlen(金币+1,VIP+0):谢谢参与讨论!
huahua1216(金币+10,VIP+0):呵呵 我看看能不能重新测一下 小小红包 喝茶
大家都是什么情况啊?
我解好后
1、void 38 Ang^3
2、游离水上的H不好加
    PLAT417_ALERT_2_B Short Inter D-H..H-D       H2A    ..  H08     ..       1.94 Ang.
      PLAT417_ALERT_2_B Short Inter D-H..H-D       H2B    ..  H08     ..       2.00 Ang.
      PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor       O2W    -   H2A    ...          ?      
3、PLAT026_ALERT_3_C Ratio Observed / Unique Reflections too Low ....         49 Perc.
检查了空间群是P21/c,用MERG    2,我觉得没错,为什么有一半衍射少了呢,而且没有OMIT过

[ Last edited by 级数收敛 on 2008-12-14 at 12:48 ]
9楼2008-12-14 10:07:16
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truelove

木虫 (小有名气)

祝小木虫越办越红火!


huahua1216(金币+1,VIP+0):P21/c 呵呵
不知道你的晶体是什么空间群的。是否可以降低对称性试试?有时候把无心的空间群用有心的空间群来解会出现类似的情况。
10楼2008-12-15 12:22:47
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