24小时热门版块排行榜    

查看: 3709  |  回复: 8

芝麻豆豆

新虫 (初入文坛)

[求助] 如何设置VESTA导出的原子坐标精度 已有1人参与

用VESTA导出的原子坐标只有小数点后十位,但是VASP中POSCAR的原子坐标小数点后有16位,请问要怎么设置才能让VESTA导出的数据符合POSCAR的要求?
金币略少,感激不尽!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

漫天飘雪

版主 (知名作家)

认真做事,踏实做人

不需要这么精确的
http://blog.sciencenet.cn/u/pfliu89
2楼2016-11-21 12:17:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

芝麻豆豆

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 漫天飘雪 at 2016-11-21 12:17:14
不需要这么精确的

找到的资料都是精确到小数点后16位
但是我导出来的都很短
见图
如何设置VESTA导出的原子坐标精度
。.png


如何设置VESTA导出的原子坐标精度-1
。。.png

3楼2016-11-21 15:32:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

827260864

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
芝麻豆豆: 金币+2, 有帮助 2016-11-22 19:02:35
利用MS,calculation保存一下,然后去保存的文件夹找.cell文件,里面有详细的坐标信息。注意.cell文件是一个隐藏文件。
向着幸福出发
4楼2016-11-21 17:02:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

芝麻豆豆

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 827260864 at 2016-11-21 17:02:45
利用MS,calculation保存一下,然后去保存的文件夹找.cell文件,里面有详细的坐标信息。注意.cell文件是一个隐藏文件。

VESTA导出的.vasp格式没办法放到MS里,还有其他办法吗
5楼2016-11-22 19:04:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

827260864

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
芝麻豆豆(蛋蛋小童鞋代发): 金币+2, 谢谢交流 2016-11-23 08:32:19
引用回帖:
5楼: Originally posted by 芝麻豆豆 at 2016-11-22 19:04:22
VESTA导出的.vasp格式没办法放到MS里,还有其他办法吗...

不是把导出的.vasp格式文件放到MS里,是指把你开始的.cif文件导入到MS里,之后MODULES-----CASTEP----CALCULATION----save.再去找.cell文件就可以啦。
向着幸福出发
6楼2016-11-22 19:45:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

芝麻豆豆

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 827260864 at 2016-11-22 19:45:01
不是把导出的.vasp格式文件放到MS里,是指把你开始的.cif文件导入到MS里,之后MODULES-----CASTEP----CALCULATION----save.再去找.cell文件就可以啦。...

试过了,但是坐标会有改变
图1是原始VESTA导出的,图2是放到MS计算后得到的,图3是再次放到VESTA里验证的
可能是两个软件对坐标计算的方法不同吗
如何设置VESTA导出的原子坐标精度-2
图1.png


如何设置VESTA导出的原子坐标精度-3
图2.png


如何设置VESTA导出的原子坐标精度-4
图3.png

7楼2016-11-22 20:07:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

827260864

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


芝麻豆豆: 金币+1 2016-11-23 21:42:38
引用回帖:
7楼: Originally posted by 芝麻豆豆 at 2016-11-22 20:07:33
试过了,但是坐标会有改变
图1是原始VESTA导出的,图2是放到MS计算后得到的,图3是再次放到VESTA里验证的
可能是两个软件对坐标计算的方法不同吗

图1.png

图2.png

图3.png
...

你导出的这两个是等价的,基矢量的取向不一样的原因。其实质是一样的。
向着幸福出发
8楼2016-11-23 09:11:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

芝麻豆豆

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 827260864 at 2016-11-23 09:11:28
你导出的这两个是等价的,基矢量的取向不一样的原因。其实质是一样的。...

坐标数值改变了也没关系吗
9楼2016-11-23 21:43:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 芝麻豆豆 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗? +4 瞬息宇宙 2026-08-31 4/200 2026-09-01 14:58 by jiaoxg
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 8/400 2026-09-01 12:58 by ssyjh
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +13 Kittylucky 2026-08-27 14/700 2026-09-01 11:06 by feng6531
[论文投稿] 小白求助 投论文要求的highlights应该如何写 5+3 l1963982152 2026-08-29 4/200 2026-09-01 09:04 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +6 叶九微 2026-08-26 6/300 2026-08-31 23:54 by yudaoqian88
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +17 爱看书的可乐 2026-08-26 19/950 2026-08-31 21:30 by xiangy672
[基金申请] 能否申诉? +7 echo8914667 2026-08-30 8/400 2026-08-31 17:00 by yihongxu
[基金申请] 基金不中,共勉 +12 eulota 2026-08-26 12/600 2026-08-31 08:42 by ZJTJZ
[基金申请] 为什么到现在没收到通知? +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 我不理解! +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
信息提示
请填处理意见