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Oceansdeep

新虫 (初入文坛)

[求助] VMD里如何筛选出最大团簇并把所有帧数值导出 已有1人参与

正在用gromacs做分子模拟,研究分子聚集状态。现在想把200个ns(200000帧)里面每一帧的最大聚集团簇的聚集数导出,VMD里的measure cluster似乎可以,但是如何使用?求大神~

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Oceansdeep

新虫 (初入文坛)

2楼2016-11-21 10:22:51
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awaken2013

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你看看gmx cluster里面的功能能不能满足
3楼2016-11-21 13:13:34
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xb490284223

金虫 (正式写手)

蘑菇头

楼主是否解决问题?我现在用VMD的measure cluster进行团簇分析,碰到一些问题。我用lammps计算后的data文件导入VMD,可以看到分子运动轨迹。现在想进行随着时间的推移,分子运动的团簇分析。请问如何实现?谢谢。如能帮忙解决,送上大量金币。
4楼2017-11-30 10:20:48
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