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yearnaruto

新虫 (小有名气)

[求助] 分子构象问题 已有1人参与

假设分子有两种构象A和B,构象A能量较高但活性位点处空间位阻小,容易反应。构象B能量较低但活性位点处空间位阻大,不易反应。那么哪一种构象更容易参与反应

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ra2ghgzh

木虫 (正式写手)

学痴

你的问题应该是哪种构象对反应的贡献更大吧?
我觉得你应该比较两种构象反应时的过渡态的能量,谁的低谁的贡献大。
我永远当不了老板
2楼2016-11-19 08:37:52
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yearnaruto

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ra2ghgzh at 2016-11-19 08:37:52
你的问题应该是哪种构象对反应的贡献更大吧?
我觉得你应该比较两种构象反应时的过渡态的能量,谁的低谁的贡献大。

就是直接找出两种构象参与反应的过渡态,计算两条路径的反应势垒?

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3楼2016-11-19 08:56:33
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ra2ghgzh

木虫 (正式写手)

学痴

引用回帖:
3楼: Originally posted by yearnaruto at 2016-11-19 08:56:33
就是直接找出两种构象参与反应的过渡态,计算两条路径的反应势垒?
...

是的,瞎猜的。
我永远当不了老板
4楼2016-11-19 09:20:46
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yongleli

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by yearnaruto at 2016-11-19 08:56:33
就是直接找出两种构象参与反应的过渡态,计算两条路径的反应势垒?
...

这属于多通道反应,请楼主计算 B-TS(B)-产物的TS能量,和B-TS(B->A)-A-TS(A)-产物的能量做一下预测。以B的基态能量为参考点。
5楼2016-11-19 10:44:14
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yearnaruto

新虫 (小有名气)

6楼2016-11-19 19:16:54
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