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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 分子构象问题
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yearnaruto

新虫 (小有名气)

[求助] 分子构象问题 已有1人参与

假设分子有两种构象A和B，构象A能量较高但活性位点处空间位阻小，容易反应。构象B能量较低但活性位点处空间位阻大，不易反应。那么哪一种构象更容易参与反应

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1楼 2016-11-18 12:14:19
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ra2ghgzh

木虫 (正式写手)

学痴
引用回帖:
3楼: Originally posted by yearnaruto at 2016-11-19 08:56:33
就是直接找出两种构象参与反应的过渡态，计算两条路径的反应势垒？
...

是的，瞎猜的。
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我永远当不了老板
4楼2016-11-19 09:20:46
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ra2ghgzh

木虫 (正式写手)

学痴
你的问题应该是哪种构象对反应的贡献更大吧？
我觉得你应该比较两种构象反应时的过渡态的能量，谁的低谁的贡献大。
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我永远当不了老板
2楼2016-11-19 08:37:52
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yearnaruto

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by ra2ghgzh at 2016-11-19 08:37:52
你的问题应该是哪种构象对反应的贡献更大吧？
我觉得你应该比较两种构象反应时的过渡态的能量，谁的低谁的贡献大。

就是直接找出两种构象参与反应的过渡态，计算两条路径的反应势垒？

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3楼2016-11-19 08:56:33
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yongleli

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by yearnaruto at 2016-11-19 08:56:33
就是直接找出两种构象参与反应的过渡态，计算两条路径的反应势垒？
...

这属于多通道反应，请楼主计算 B-TS(B)-产物的TS能量，和B-TS(B->A)-A-TS(A)-产物的能量做一下预测。以B的基态能量为参考点。
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5楼2016-11-19 10:44:14
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