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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长

[交流] 【求助】vmd异常退出问题

在RHEL AS4 UPDATE 4中装vmd,装上之后可以正常载入 mol2分子,但是一但载入pdb格式的大分子程序就异常关闭,请问如何解决?谢谢!

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 14:13 ]
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maomao6972

木虫 (著名写手)

VMD


gwdavid(金币+1,VIP+0):谢谢!但不是画图软件,是与NAMD配合使用的三维显示及结果分析软件
楼主说的VMD是指画图软件吗
我有在win下装
他可以打开.cub文件
我用的就是VMD来画轨道图
2楼2008-12-02 21:36:38
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linda6382


lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 5-19 19:44
是不是你装程序没都安装上啊
3楼2009-05-19 11:37:42
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bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州

★ ★ ★ ★
lei0736(金币+4,VIP+0):谢谢 5-19 19:44
参考http://www.mdbbs.org/viewthread.php?tid=13135

by bay__gulf618
遇到过,红旗6
用 mol   load   pdb    ***.pdb 出现这种问题
提示XIM 字体错误,未解决
用 mol   new   ***.psf     mol   addfile   ***.pdb  可以加载
在别的系统上要么装不上,要么正常使用。

by weishenme
RHEL4,VMD1.8.6也是这样。无奈,我每次都用vmd -debug打开,然后输入run,再敲几个回车,这样打开vmd就能正常打开pdb文件了,呵呵。
ps,VMD1.8.5在RHEL4是正常的,VMD1.8.6在RHEL5是正常的。
4楼2009-05-19 12:52:39
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honeyman

铁杆木虫 (正式写手)

我也用VMD,请问轨道图怎么画的啊?
5楼2009-05-28 16:39:13
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