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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】vmd异常退出问题
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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长

[交流] 【求助】vmd异常退出问题

在RHEL AS4 UPDATE 4中装vmd,装上之后可以正常载入 mol2分子，但是一但载入pdb格式的大分子程序就异常关闭，请问如何解决？谢谢！

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 14:13 ]
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1楼 2008-12-02 19:11:54
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maomao6972

木虫 (著名写手)

VMD

★
gwdavid(金币+1,VIP+0):谢谢！但不是画图软件，是与NAMD配合使用的三维显示及结果分析软件
楼主说的VMD是指画图软件吗
我有在win下装
他可以打开.cub文件
我用的就是VMD来画轨道图
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2楼2008-12-02 21:36:38
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linda6382

★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 5-19 19:44
是不是你装程序没都安装上啊
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3楼2009-05-19 11:37:42
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bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州
★ ★ ★ ★
lei0736(金币+4,VIP+0):谢谢 5-19 19:44
参考http://www.mdbbs.org/viewthread.php?tid=13135

by bay__gulf618
遇到过，红旗6
用 mol   load   pdb    ***.pdb 出现这种问题
提示XIM 字体错误，未解决
用 mol   new   ***.psf     mol   addfile   ***.pdb  可以加载
在别的系统上要么装不上，要么正常使用。

by weishenme
RHEL4，VMD1.8.6也是这样。无奈，我每次都用vmd -debug打开，然后输入run，再敲几个回车，这样打开vmd就能正常打开pdb文件了，呵呵。
ps，VMD1.8.5在RHEL4是正常的，VMD1.8.6在RHEL5是正常的。
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4楼2009-05-19 12:52:39
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honeyman

铁杆木虫 (正式写手)
我也用VMD，请问轨道图怎么画的啊？
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5楼2009-05-28 16:39:13
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