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chenlin12345

金虫 (正式写手)

[求助] 请教知道一个菌株全基因组信息,怎么算出他的GC含量,谢谢~ 已有2人参与

知道一个菌株全基因组信息,怎么算出他的GC含量?
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认真做自己
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小冀-

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【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
NCBI上可以直接查到的,在基因组信息里都有~

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

···
3楼2016-11-18 18:51:04
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二十一业

铜虫 (小有名气)

17楼2016-11-24 13:55:50
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普通回帖

nanhu1984

银虫 (正式写手)

方法太多,有个最笨的方法,下载一个clc work bench软件(试用版),导入基因组序列,统计结果就知道GC%

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

https://www.microbialgenomic.cn/
2楼2016-11-16 13:12:13
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小冀-

版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

就是像这种,输入菌名~信息里就都有了
请教知道一个菌株全基因组信息,怎么算出他的GC含量,谢谢~
捕获.PNG

···
4楼2016-11-18 18:52:19
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chenlin12345

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 小冀- at 2016-11-18 18:51:04
NCBI上可以直接查到的,在基因组信息里都有~

自己测的去基因组信息
认真做自己
5楼2016-11-21 22:51:15
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chenlin12345

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 小冀- at 2016-11-18 18:52:19
就是像这种,输入菌名~信息里就都有了

捕获.PNG

谢谢~自己测序出的去基因组信息
认真做自己
6楼2016-11-21 22:52:08
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chenlin12345

金虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by nanhu1984 at 2016-11-16 13:12:13
方法太多,有个最笨的方法,下载一个clc work bench软件(试用版),导入基因组序列,统计结果就知道GC%

谢谢,我试一下~有什么问题在请教
认真做自己
7楼2016-11-21 22:52:56
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chenlin12345

金虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by 小冀- at 2016-11-18 18:51:04
NCBI上可以直接查到的,在基因组信息里都有~

可能是之前表达的不是很清楚,谢谢
认真做自己
8楼2016-11-21 22:55:24
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chenlin12345

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by nanhu1984 at 2016-11-16 13:12:13
方法太多,有个最笨的方法,下载一个clc work bench软件(试用版),导入基因组序列,统计结果就知道GC%

还有其他方法吗?跪求
认真做自己
9楼2016-11-21 23:17:19
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祝福
10楼2016-11-22 01:01:38
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