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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 请教知道一个菌株全基因组信息，怎么算出他的GC含量，谢谢~
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chenlin12345

金虫 (正式写手)

[求助] 请教知道一个菌株全基因组信息，怎么算出他的GC含量，谢谢~ 已有2人参与

知道一个菌株全基因组信息，怎么算出他的GC含量？
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认真做自己
1楼 2016-11-15 23:29:34
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

小冀-

版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
NCBI上可以直接查到的，在基因组信息里都有~
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chenlin12345
···
3楼2016-11-18 18:51:04
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二十一业

铜虫 (小有名气)
内容已删除
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17楼2016-11-24 13:55:50
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普通回帖

nanhu1984

银虫 (正式写手)
方法太多，有个最笨的方法，下载一个clc work bench软件（试用版），导入基因组序列，统计结果就知道GC%
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

chenlin12345
https://www.microbialgenomic.cn/
2楼2016-11-16 13:12:13
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小冀-

版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

就是像这种，输入菌名~信息里就都有了
请教知道一个菌株全基因组信息，怎么算出他的GC含量，谢谢~
捕获.PNG
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···
4楼2016-11-18 18:52:19
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chenlin12345

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 小冀- at 2016-11-18 18:51:04
NCBI上可以直接查到的，在基因组信息里都有~

自己测的去基因组信息
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认真做自己
5楼2016-11-21 22:51:15
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chenlin12345

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 小冀- at 2016-11-18 18:52:19
就是像这种，输入菌名~信息里就都有了

捕获.PNG

谢谢~自己测序出的去基因组信息
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认真做自己
6楼2016-11-21 22:52:08
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chenlin12345

金虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by nanhu1984 at 2016-11-16 13:12:13
方法太多，有个最笨的方法，下载一个clc work bench软件（试用版），导入基因组序列，统计结果就知道GC%

谢谢，我试一下~有什么问题在请教
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认真做自己
7楼2016-11-21 22:52:56
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chenlin12345

金虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by 小冀- at 2016-11-18 18:51:04
NCBI上可以直接查到的，在基因组信息里都有~

可能是之前表达的不是很清楚，谢谢
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认真做自己
8楼2016-11-21 22:55:24
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chenlin12345

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by nanhu1984 at 2016-11-16 13:12:13
方法太多，有个最笨的方法，下载一个clc work bench软件（试用版），导入基因组序列，统计结果就知道GC%

还有其他方法吗?跪求
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认真做自己
9楼2016-11-21 23:17:19
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nuktyym81
祝福
10楼2016-11-22 01:01:38
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