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David_王

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助,TA克隆卡了俩星期了,挑不到正确连接的阳性克隆!已有7人参与

目标是把重叠PCR获得的一个3kb的回收片段通过TA克隆连接到T载体上。PCR片段是通过Takara的高保真酶获得的,胶回收以后测得浓度是47ng/ul。将回收片段Taq酶加A尾(做的50ul的大体系,回收片段加了15ul,72℃延伸30min)。然后取了4.5ul的加A尾载体片段,加了0.5ul的pMD18-T,5ul的Solution 1
(Takara)16℃过夜连接。10ul连接体系全部转化DH5α感受态(康维世纪)涂Amp+板。板上几乎长满了,但挑出来摇过夜提质粒,电泳后发现大小都在1300bp左右(考虑到质粒的超螺旋形态,应该都是空载体?)所以现在问题出在哪里?是overlap回收的PCR片段有问题吗?还是连接时回收片段和载体的比例有问题?求大神指点  /(ㄒoㄒ)/~~ 要毕业好着急~~~~~!
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David_王

新虫 (初入文坛)

谢谢大家的建议和帮助。问题已经解决了。好久了,现在想起来总结一下。我重新overlap扩增了片段,回收回来浓度比以前高了,并且加A尾的过程延长到了30min,换了新的T载体(之前的时间可能有点久,效率比较低,现在回头看应该是自连比较多),用了蓝白斑预筛选,最后挑的8个克隆里有1个提质粒后酶切验证是正确,送测序也证明连上了,没有问题。同时做的另一个片段连T载体很顺利,6个克隆全都正确,看来大片段连T载体效率还是不太高的。
25楼2016-12-12 18:57:25
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wangranjun

荣誉版主 (知名作家)

广庭之惘然

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-11-22 23:41:15
xn8008: 应助指数+1 2016-11-22 23:41:26
David_王: 金币+5, 有帮助 2016-12-12 18:51:43
没有用蓝白斑方法进行预筛选?
他日扬翼九万里,历大千世界,定我红尘心!
2楼2016-11-14 16:47:29
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小冀-

版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-11-22 23:41:38
xn8008: 应助指数+1 2016-11-22 23:41:43
引用回帖:
2楼: Originally posted by wangranjun at 2016-11-14 16:47:29
没有用蓝白斑方法进行预筛选?

第一.taq加A效果不好,你可以用加A试剂盒试试,第二,18T加的少了吧~一般加A连接我们最多连接三个小时,效率很高的,没必要过夜

发自小木虫Android客户端
···
3楼2016-11-14 17:31:50
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kaobo2012

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
一般大于2Kb的片段,都是通过双酶切连接到载体中去的。
4楼2016-11-14 19:09:59
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