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David_王

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助,TA克隆卡了俩星期了,挑不到正确连接的阳性克隆!已有7人参与

目标是把重叠PCR获得的一个3kb的回收片段通过TA克隆连接到T载体上。PCR片段是通过Takara的高保真酶获得的,胶回收以后测得浓度是47ng/ul。将回收片段Taq酶加A尾(做的50ul的大体系,回收片段加了15ul,72℃延伸30min)。然后取了4.5ul的加A尾载体片段,加了0.5ul的pMD18-T,5ul的Solution 1
(Takara)16℃过夜连接。10ul连接体系全部转化DH5α感受态(康维世纪)涂Amp+板。板上几乎长满了,但挑出来摇过夜提质粒,电泳后发现大小都在1300bp左右(考虑到质粒的超螺旋形态,应该都是空载体?)所以现在问题出在哪里?是overlap回收的PCR片段有问题吗?还是连接时回收片段和载体的比例有问题?求大神指点  /(ㄒoㄒ)/~~ 要毕业好着急~~~~~!
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意萧02

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
David_王: 金币+5, 有帮助 2016-12-12 18:52:41
给你个比较实际性操作建议:
(1)酶切载体时可以先磷酸化一下,加0.5-1ul的Fast-AP,这样连接更容易些;
(2)4℃连接过夜
(3)NEB的T4连接酶

如果实在没办法,给你个绝招:无缝克隆!!!
推荐一款无缝连接的试剂盒:诺唯赞的multis chone kit,自从用了这个再也没用过T4,什么10k片段,互补载体构建都不成问题。
(因为好用,绝对不是推销,你也可以用其他公司的无缝克隆试剂盒,原理一模一样,没差别);

感谢我吧!!!!
23楼2016-11-17 15:35:45
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wangranjun

荣誉版主 (知名作家)

广庭之惘然

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-11-22 23:41:15
xn8008: 应助指数+1 2016-11-22 23:41:26
David_王: 金币+5, 有帮助 2016-12-12 18:51:43
没有用蓝白斑方法进行预筛选?
他日扬翼九万里,历大千世界,定我红尘心!
2楼2016-11-14 16:47:29
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小冀-

版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-11-22 23:41:38
xn8008: 应助指数+1 2016-11-22 23:41:43
引用回帖:
2楼: Originally posted by wangranjun at 2016-11-14 16:47:29
没有用蓝白斑方法进行预筛选?

第一.taq加A效果不好,你可以用加A试剂盒试试,第二,18T加的少了吧~一般加A连接我们最多连接三个小时,效率很高的,没必要过夜

发自小木虫Android客户端
···
3楼2016-11-14 17:31:50
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kaobo2012

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
一般大于2Kb的片段,都是通过双酶切连接到载体中去的。
4楼2016-11-14 19:09:59
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