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匿名

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1楼 2016-11-13 15:23:34
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brucefan

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
看看Berendsen1984年发表在JCP的文章，一切将会明白。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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2楼2016-11-13 16:05:50
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匿名

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3楼2016-11-13 20:10:06
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匿名

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4楼2016-11-14 12:58:40
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cgzhang_gg

铜虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by healthappy at 2016-11-14 12:58:40
求告知啊，temp/berendsen 和press/berendsen怎么结合起来用啊

units metal
fix 1 all npt temp Tstart Tstop Tdamp iso Pstart Pstop Pdamp

温度单位:  K， 时间单位：ps,  压强单位: bar， Tdamp=5 fs = 0.005 ps,  所以 Tdamp 取 0.005，Pdamp = 1000 fs = 1 ps, Pdamp 取 1

fix 1 all npt temp 300.0 300.0 0.005 iso 1.0 1.0 1.0
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5楼2016-11-18 08:23:30
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董小莹

新虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by cgzhang_gg at 2016-11-18 08:23:30
units metal
fix 1 all npt temp Tstart Tstop Tdamp iso Pstart Pstop Pdamp

温度单位:  K， 时间单位：ps,  压强单位: bar， Tdamp=5 fs = 0.005 ps,  所以 Tdamp 取 0.005，Pdamp = 1000 fs = 1 ps, Pdamp  ...

想问一下 这个Tdump是5fs是从哪里知道的呢？

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6楼2018-06-04 20:31:05
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董小莹

新虫 (正式写手)
不好意思 看到了

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7楼2018-06-04 21:24:10
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