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惊讶~呵呵

新虫 (小有名气)

[求助] 启动子序列分析怎么做? 已有1人参与

已经有了基因序列全长,怎么样做基因启动子序列分析呢?需要用到什么软件?求指教!!!

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longanzz

至尊木虫 (著名写手)

如果有这个物种的基因组的信息,可以找到这个基因的启动子的序列。如果没有,可以用染色体步移方法得到启动子的序列。
9楼2016-11-09 20:53:45
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惊讶~呵呵

新虫 (小有名气)

做过启动子序列分析的求指导(拜托)

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2楼2016-11-08 23:48:46
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longanzz

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
惊讶~呵呵: 金币+2, 有帮助 2016-11-09 13:14:44
有专门的网站分析,植物的有一个,动物的不太清楚。
3楼2016-11-09 08:04:40
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惊讶~呵呵

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by longanzz at 2016-11-09 08:04:40
有专门的网站分析,植物的有一个,动物的不太清楚。

您能把植物的那个网站链接发给我吗?非常感谢!!!

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4楼2016-11-09 13:11:35
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longanzz

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
惊讶~呵呵: 金币+8, ★★★很有帮助 2016-11-09 18:18:14
你现在是有启动子序列了吗?还是只有基因的序列?如果只有基因的序列,还需要找到启动子的序列,在分析其中的调控软件。
http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/这个是植物启动子调控软件分析网站。
5楼2016-11-09 15:02:04
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惊讶~呵呵

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by longanzz at 2016-11-09 15:02:04
你现在是有启动子序列了吗?还是只有基因的序列?如果只有基因的序列,还需要找到启动子的序列,在分析其中的调控软件。
http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/这个是植物启动子调控软件分 ...

我就只是有基因序列,没有找到启动子序列,那应该怎么找呢?

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6楼2016-11-09 18:18:02
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nakice

铁杆木虫 (正式写手)

有基因序列没用的,启动子在基因上游。你可以根据基因往上推,一般上游2K

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奋斗就是生活,人生只有前进
7楼2016-11-09 18:26:48
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惊讶~呵呵

新虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by nakice at 2016-11-09 18:26:48
有基因序列没用的,启动子在基因上游。你可以根据基因往上推,一般上游2K

我们这边没有人做过,我是完全不会做。麻烦你多多指教了

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8楼2016-11-09 18:41:17
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惊讶~呵呵

新虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by longanzz at 2016-11-09 20:53:45
如果有这个物种的基因组的信息,可以找到这个基因的启动子的序列。如果没有,可以用染色体步移方法得到启动子的序列。

非常感谢!!!

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10楼2016-11-11 09:55:10
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