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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 启动子序列分析怎么做？
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惊讶~呵呵

新虫 (小有名气)

[求助] 启动子序列分析怎么做？ 已有1人参与

已经有了基因序列全长，怎么样做基因启动子序列分析呢？需要用到什么软件？求指教！！！

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1楼 2016-11-07 21:41:43
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longanzz

至尊木虫 (著名写手)
如果有这个物种的基因组的信息，可以找到这个基因的启动子的序列。如果没有，可以用染色体步移方法得到启动子的序列。
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9楼2016-11-09 20:53:45
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惊讶~呵呵

新虫 (小有名气)
做过启动子序列分析的求指导（拜托）

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2楼2016-11-08 23:48:46
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longanzz

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
惊讶~呵呵: 金币+2, ★有帮助 2016-11-09 13:14:44
有专门的网站分析，植物的有一个，动物的不太清楚。
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3楼2016-11-09 08:04:40
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惊讶~呵呵

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by longanzz at 2016-11-09 08:04:40
有专门的网站分析，植物的有一个，动物的不太清楚。

您能把植物的那个网站链接发给我吗？非常感谢！！！

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4楼2016-11-09 13:11:35
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longanzz

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
惊讶~呵呵: 金币+8, ★★★很有帮助 2016-11-09 18:18:14
你现在是有启动子序列了吗？还是只有基因的序列？如果只有基因的序列，还需要找到启动子的序列，在分析其中的调控软件。
http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/这个是植物启动子调控软件分析网站。
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5楼2016-11-09 15:02:04
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惊讶~呵呵

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by longanzz at 2016-11-09 15:02:04
你现在是有启动子序列了吗？还是只有基因的序列？如果只有基因的序列，还需要找到启动子的序列，在分析其中的调控软件。
http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/这个是植物启动子调控软件分 ...

我就只是有基因序列，没有找到启动子序列，那应该怎么找呢？

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6楼2016-11-09 18:18:02
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nakice

铁杆木虫 (正式写手)
有基因序列没用的，启动子在基因上游。你可以根据基因往上推，一般上游2K

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奋斗就是生活，人生只有前进
7楼2016-11-09 18:26:48
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引用回帖:
7楼: Originally posted by nakice at 2016-11-09 18:26:48
有基因序列没用的，启动子在基因上游。你可以根据基因往上推，一般上游2K

我们这边没有人做过，我是完全不会做。麻烦你多多指教了

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8楼2016-11-09 18:41:17
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新虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by longanzz at 2016-11-09 20:53:45
如果有这个物种的基因组的信息，可以找到这个基因的启动子的序列。如果没有，可以用染色体步移方法得到启动子的序列。

非常感谢！！！

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10楼2016-11-11 09:55:10
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