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li_yi_2004

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】分子结构优化

我用# opt=tight HF/6-31G* geom=connectivity volume polar优化了下列结构,但是输入中的C=S(图1)在优化结果中变成了C-S(图2),不知道原因,请大虾指点.

[ Last edited by lei0736 on 2008-12-2 at 10:54 ]
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erylingjet

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★
gwdavid(金币+2,VIP+0):谢谢!
键长应该发生变化了吧?

可能是软件显示的问题

你用其它看看,如3D
2楼2008-12-01 09:24:21
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li_yi_2004

新虫 (初入文坛)

用Mercury 1.4.2软件打开,仍然是单键
3楼2008-12-01 09:44:28
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张文艳

交流!

★ ★ ★
gwdavid(金币+3,VIP+0):谢谢交流!欢迎再次光临模拟版!
图2显示的是正确的,因为C连接的两个N的电负性要比S强多了,你看N-C-N之间已经形成了离域键,2个N把C上的电子吸引过来,C上电子少了,他对S的束缚能力减弱了,所以C-S键就变成了单键。
4楼2008-12-01 09:56:33
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maomao6972

木虫 (著名写手)

楼上说的在理~
5楼2008-12-01 10:01:35
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li_yi_2004

新虫 (初入文坛)


gwdavid(金币+1,VIP+0):谢谢交流!欢迎再次光临模拟版!
硫脲的C=S就是双键,并不是单键
6楼2008-12-01 10:14:00
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quantumor

金虫 (著名写手)

快乐兔子

★ ★ ★
gwdavid(金币+3,VIP+0):谢谢交流!欢迎再次光临模拟版!
首先声明,我只是小虾,其次,你是新虫,我不要你的金币。下面是我的看法和一点忠告。
1、优化结果与输入结构不同,这是很正常的,因为优化是在寻找能量低点的结构。
2、任何软件显示的“单键”、“双键”只是形式上的,我们绝不能仅凭图形上的“单、双”来认定实际结构中的键是否为单、双键,而要实际去测量一下键长的数据再行判断。
3、做计算模拟千万不要只看到形式,那是很危险的,那样很容易使人只知然,而不知其所以然。
愿好运与快乐伴随你!
7楼2008-12-01 11:57:52
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yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛,狼的耳朵,豹的速 ...

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
同意楼上的说法,单键双键是看原子的距离,计算出来的距离是再什么范围内gview就显示什么键。这很正常。这有许多原因导致键发生改变,你要实在看不惯自己改成双键好了。但是这两个原子之间的作用肯定没有双键强的
人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的,轻易地放弃了不该放弃的……
8楼2008-12-01 13:50:35
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pllyf2006

金虫 (著名写手)


lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢
gview是根据自己的键长定义范围来区分单键或双键的,不用看显示的形式,应该自己测量
9楼2008-12-01 16:18:07
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li_yi_2004

新虫 (初入文坛)

优化结果C-S键长是1.6857,应该是单键还是双键?
10楼2008-12-01 17:04:04
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