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lusandanooo银虫 (小有名气)
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请教，如何预测一个蛋白和另一个基因有相互作用关系？ 已有3人参与
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已知条件：原核生物，某蛋白A能结合某靶基因B，蛋白A有一个同源蛋白a，基因B有一个同源基因b。无文献报道a和b有相互作用。 问题：如何用生物信息学手段预测a和b之间有相互作用（a能结合到b的启动子上）？ |
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lusandanooo
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11楼2016-11-07 09:58:51
lusandanooo
银虫 (小有名气)
4楼2016-11-03 08:47:24
【答案】应助回帖
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| 小分子能否和protein作用可以用对接，大分子（dna）和protein作用也可以预测，有软件的。这是我几年前看到的文献，现在忘了名字了。 不过预测结果非常不准确。 如果有AB的晶体结构你可以看看晶体结构中AB的internation interface残基和核苷酸如何作用的。 找到同源蛋白a和同源基因b同样位置的残疾与核苷酸，看结构是否差异较大，如果差异较小，那么认为很可能有相互作用。 |
5楼2016-11-03 09:05:29
lusandanooo
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6楼2016-11-03 17:20:37
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