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fuuuck

新虫 (初入文坛)

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专业: 药物设计与药物信息

[求助] PDB文件中的_atom_site.label_atom_id

想请教各位在PDB文件中的AtomName究竟是按照什么标准定义的？谢谢！
ATOM    10  C CYS A
ATOM    11  O CYS A
ATOM    12  N GLU A
ATOM    13  HN  GLU A
ATOM    14  CA  GLU A
ATOM    15  HA  GLU A
ATOM    16  CB  GLU A
ATOM    17  HB1 GLU A
就是上面的C HB1，这些AtomType，在PDB中被称为_atom_site.label_atom_id，指向_chem_comp_atom.atom_id，看了半天没有找到具体的规则，其中的OCT类型原子gromacs就不能识别。非常感谢！

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1楼 2016-11-01 16:59:03

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