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miatian1010

新虫 (初入文坛)

[求助] 急求助：如何找到这个基因剪切体的编码蛋白质的核苷酸序列，求详细步骤，非常感谢

我想找到一个蛋白的4个剪切体的核苷酸序列，其中larp7003 和002包含内含子，又没有说明如何拼接，想找到他们的编码区，如下图及网址：

http://asia.ensembl.org/Mus_musculus/Transcript/Sequence_cDNA?db=core;g=ENSMUSG00000027968;r=3:127536714-127553349;t=ENSMUST00000195976;tl=TEm7uLIxJ6uncP7m-2216102-575424171

   

1 TGAAAACCAAAAAACTATGGAAGAAAGCACTAAGAGAAAAGAAGAAAAAAAGAAGCGCTC     60

                                           R                              
    61 CCGGGTTAAACAGGTGCTTGCAGATATTGCTAAGCAGGTGGACTTCTGGTTTGGAGATGC    120

                        R                                                
   121 AAACCTTCACAAGGACAAGTTTCTGCGAGAGCAAATTGAAAAGTCTAGAGATGGATATGT    180

                                                                          
   181 GGACATTTCTCTCCTGGTGTCTTTTAACAAAATGAAGAAGCTGACAACTGATGGGAAGCT    240

                             **************************************      
   241 AATAGCCAGAGCATTGAAAAGCTCATCTGTTGTAGAGGTAAAAAACTTACATTTCAAGTC    300

       *************************************************Y**********      
   301 ACCCACATCCAATTAACTACTGACTTTATTTAGCTTTCCTTTTTTTTTCCCCCCTCATAA    360

       ************************************************************      
   361 AGTTGGACTTAGAAGGGACCAGAATCAGGAGGAAAAAACCCCTAGGTGAGAGACCAAAGG    420

       *Y*****R****************************************************      
   421 ACGAGGAGGAACGCACGGTATATGTGGAGTTGCTCCCCAAAAATGTTACTCATAGCTGGA    480

       ************************************************************      
   481 TTGAGAGAGTATTTGGGAAATGTGGCAATGTGGTTTACATAAGTATTCCACATTACAAGT    540

       *************************                           R              
   541 CTACTGGGGATCCTAAGGGATTTGCCTTTGTGGAATTTGAAACAAAAGAGCAAGCAGCAA    600

                                                                          
   601 AAGCCATTGAGTTTCTGAACAACCCACCAGAAGAAGCACCTAGAAAGCCTGGTATATTTC    660

                                           R    R      R                  
   661 CCAAGACAGTGAAAAACAAGCCCATCCCTTCCTTACGAGTAGCAGGTGAGTGCTTACTTA    720

         K            Y                                                   
   721 GAGTGGCCAAGTAAACAATAAACTATTATGACTGTAAATAATAAAATCTTGTTACAGAAG    780

                                                                          
   781 AGAAGAAAAAGAAGAAAAAGAAAAAAGGCAGAATAAAGAAGGAAGAGAGTGTGCAGGCCA    840

                                       S                                 
   841 AAGAGTCGGCCGTGGACAGCAGCAGCTCGGGCGTGTGTAAAGCCACGAAGAGACCAAGGA    900

                         R                                                
   901 CGGCCTCTGAGGGCTCCGAAGCAGAAACCCCGGAAGCTCCAAAGCAACCTGCAAAGAAAA    960

                                                      K                  
   961 AGAAGAAGCGGGACAAGGTGGAAGCATCCAGCTTACCTGAAGCCAGGGCAGGGAAGAGGG   1020

                                                        W                 
  1021 AGAGGTGCAGCGCCGAGGACGAAGACTGCCTCCCCCCAAGGCCAAAAGCTAAGAAAAGGG   1080

                        R                                                
  1081 CTCAGAAGGATGGCGTCGGCCAAGCAGCTTCCGAGGTCTCCAAGGAGAGCAGAGACTTAG   1140

                                       **                                 
  1141 AATTCTGCTCTACTGAGGAGGAGAAGGAGACAGACAGAAAAGGTGACTCACTCTCAAAGG   1200

                                                                          
  1201 TGAAGAGGAAGCATAAGAAGAAACACAAGGAGAGACATAAGATGGGCGAGGAGGTTATAC   1260

         Y                                                               
  1261 CATTGAGAGTGCTGTCCAAGACTGAATGGATGGATTTGAAGAAAGAGTATTTGGCACTGC   1320

                                                                          
  1321 AAAAAGCTAGCATGGCTTCTCTAAAAAAAACAATATCTCAAATCAAATTGGAATCAGAAA   1380

                                                                          
  1381 TGGAAACAGAC                                                    1391



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