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wax54

铜虫 (小有名气)


[资源] wien2k在amd架构服务器上整个的编译过程与大家分享

wien2k在amd架构服务器上整个的编译过程与大家分享

[ Last edited by wuli8 on 2008-12-8 at 11:25 ]
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wax54

铜虫 (小有名气)



fegg7502(金币+1,VIP+0):thanks
4、数学库的安装
     数学库的选择颇为麻烦。听说对于amd的平台,pgi+libgoto运算最快。对数学库不熟悉的我最初尝试了用intel的ifort,icc和intel的mkl。我发现mkl的设置非常麻烦,尤其9和10架构有较大的差异,导致很难编译成功(尽管我参考了那篇著名的《Compiling Wien2k on Intel based systems with Suse Linux》)。按照Fecher的建议,我选择了mkl9,但是设置并行的时候还需要自己从网上下载blacs,scalapack等等,编译起来非常麻烦,极有可能设置错误。mkl10包含了scalapack,但是userguide对结构的介绍让人头疼。后来参考了一位网友编译的例子(对不起,现在找不到那篇帖子了,无法指名出处),感觉编译过程中参数设置非常奇怪,即使编译通过,运算过程还是出现错误。后来我发现了张挺的一篇关于上海超级计算中心编译wien2k的文章,按照上面的介绍,我选择了amd的核心数学库acml3.1,不过为了方便并减少可能出错的环节,我选择了amdscalapck3.1。这两个数学库安装起来相当容易,没有了繁琐的makefile的设置过程,只要install就可以了。
6楼2008-12-01 13:31:27
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liminfang


★ ★
wuchenwf(金币+2,VIP+0):谢谢你的回答,欢迎参加讨论
我使用过gunplot需要一定的编程命令,并且要把数据例外存储!!!
2楼2008-11-28 22:21:47
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wax54

铜虫 (小有名气)


★ ★
fegg7502(金币+1,VIP+0):鼓励讨论
fegg7502(金币+1,VIP+0):鼓励讨论,能否再写详细点,以供其他人参考?
昨天和一个老师一起编译wien,他装suse的时候把所有的选项都选上了,gnuplot也自动装上了,按照我的编译步骤试验,结果运行TiC,直接就把图显示出来了。唉~~,帮他弄了半天结果把自己的问题给解决了,呵呵。
3楼2008-11-29 13:12:01
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wax54

铜虫 (小有名气)



fegg7502(金币+1,VIP+0):thanks
应管理员的要求,我准备把wien2k在amd架构服务器上整个的编译过程与大家分享。希望可以对初接触wien的虫友一些帮助。在下其实也刚刚接触,能力有限,错误之处还望各位多多指正。另外,由于本人对wien2k的程序还不熟悉,也希望就计算过程中出现的问题与大家多多交流。
1、系统的安装
    因为要用服务器搭建一个简单的集群,为了参考车静光老师的《微机集群组建、优化和管理》,所以决定选用suse linux。我用的是enterprise sever x86-64版。设置需要安装软件的时候,即使全部选中也还有很多的package没有安装。这时,可以按detail键,选择package group在其中查找gunplot,将其选中,否这运行wien2k的时候无法显示态密度图。
4楼2008-12-01 13:09:22
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