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play900325铁虫 (小有名气)
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positional parameter怎么转换成以angstrom做单位的cartesian坐标？ 已有1人参与
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晶体版的虫友们好！ 我最近需要从文献里面找几个晶体结构的数据和我的计算结果做比对，就是需要实验的geometry。我下了好几篇很老的文献，里面关于positional parameter的部分都很奇怪。我直接放在可视化软件中原子会挤到一起，用键长键角可以得到部分结构，但因为缺少二面角数据，我想要了解的conformation还是没办法得到。 文献里面positional parameter会给这种数据： O1' -0.1091 -0.3326 -0.4368 C1' -0.1576 -0.3346 -0.2425 然后还会说明这两个原子的distance是1.444 angstrom。但我完全不知道是怎么得到的，就算这个是Bohr单位转换成angstrom得到的数据也不对。我想请教一下做晶体的各位，我怎么从positional parameter里面得到我需要的适合量子化学计算的geometry啊？就是单位angstorm，谢谢各位！ |
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magicmonk
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3楼2016-10-27 15:55:36