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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 差异基因GO富集分析无显著的富集项
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憨憨可爱多

木虫 (正式写手)

[求助] 差异基因GO富集分析无显著的富集项

在做转录组差异基因GO富集分析的时候，在校正后的P-Value<0.05阈值下无显著的富集项目，请问这样的结果正常么？对后续分析有什么影响啊？有没有类似的情况发生啊，貌似目前我自己还没有看到过类似的文章。请各位大神指教指教啊。
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1楼 2016-10-10 09:19:39
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偶尔--apple

铁虫 (初入文坛)
你好，我遇到了类似的情况，请问你的数据后面怎么处理了，谢谢~
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8楼2016-11-30 12:19:02
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xingzhou823

木虫 (正式写手)

五道杠

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
请问是什么物种？模式生物吗？

差异基因的个数是多少？ 如果太少，有可能得不到显著富集的结果的。

还有就是，使用什么工具做的GO富集分析，正确吗？
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你，长大了吗？~有目的的希望小木虫不要倒闭
2楼2016-10-11 09:33:18
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憨憨可爱多

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by xingzhou823 at 2016-10-11 09:33:18
请问是什么物种？模式生物吗？

差异基因的个数是多少？ 如果太少，有可能得不到显著富集的结果的。

还有就是，使用什么工具做的GO富集分析，正确吗？

我的材料是木荷，一种木本植物，做的无参转录组，差异基因数量的话，算中等吧，富集是公司帮忙做的，p值为1，没有显著富集

发自小木虫IOS客户端
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3楼2016-10-11 23:30:48
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xingzhou823

木虫 (正式写手)

五道杠

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
憨憨可爱多: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2016-10-13 14:39:50
憨憨可爱多: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2016-10-14 09:40:16
引用回帖:
3楼: Originally posted by 憨憨可爱多 at 2016-10-11 23:30:48
我的材料是木荷，一种木本植物，做的无参转录组，差异基因数量的话，算中等吧，富集是公司帮忙做的，p值为1，没有显著富集
...

没有显著富集，那就是没有统计学意义，不建议使用。
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你，长大了吗？~有目的的希望小木虫不要倒闭
4楼2016-10-13 14:36:24
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