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憨憨可爱多

木虫 (正式写手)

[求助] 差异基因GO富集分析无显著的富集项

在做转录组差异基因GO富集分析的时候,在校正后的P-Value<0.05阈值下无显著的富集项目,请问这样的结果正常么?对后续分析有什么影响啊?有没有类似的情况发生啊,貌似目前我自己还没有看到过类似的文章。请各位大神指教指教啊。
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憨憨可爱多

木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by xingzhou823 at 2016-10-13 14:36:24
没有显著富集,那就是没有统计学意义,不建议使用。...

那请问下这样是否会对整个转录组结果造成影响?那可能是什么原因造成的呢?处理的材料本身差异较小还是什么原因。
5楼2016-10-13 14:41:04
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xingzhou823

木虫 (正式写手)

五道杠

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
请问是什么物种?模式生物吗?

差异基因的个数是多少? 如果太少,有可能得不到显著富集的结果的。

还有就是,使用什么工具做的GO富集分析,正确吗?
你,长大了吗?~有目的的希望小木虫不要倒闭
2楼2016-10-11 09:33:18
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憨憨可爱多

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xingzhou823 at 2016-10-11 09:33:18
请问是什么物种?模式生物吗?

差异基因的个数是多少? 如果太少,有可能得不到显著富集的结果的。

还有就是,使用什么工具做的GO富集分析,正确吗?

我的材料是木荷,一种木本植物,做的无参转录组,差异基因数量的话,算中等吧,富集是公司帮忙做的,p值为1,没有显著富集

发自小木虫IOS客户端
3楼2016-10-11 23:30:48
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xingzhou823

木虫 (正式写手)

五道杠

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
憨憨可爱多: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2016-10-13 14:39:50
憨憨可爱多: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2016-10-14 09:40:16
引用回帖:
3楼: Originally posted by 憨憨可爱多 at 2016-10-11 23:30:48
我的材料是木荷,一种木本植物,做的无参转录组,差异基因数量的话,算中等吧,富集是公司帮忙做的,p值为1,没有显著富集
...

没有显著富集,那就是没有统计学意义,不建议使用。
你,长大了吗?~有目的的希望小木虫不要倒闭
4楼2016-10-13 14:36:24
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