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8095172666

银虫 (小有名气)

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[求助] 转录组分析 FDR值已有1人参与

最近做了一次转录组分析，交给公司做的，最后发给我的对照表格里FDR值几乎全部为1。在以FDR小于0.05时，筛选差异基因时为0。请问各位老师这种情况是什么原因，那我最后结果难道就是两个样之间没有差异？

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1楼 2016-10-09 14:39:40

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xingzhou823

木虫 (正式写手)

五道杠

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【答案】应助回帖

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8095172666: 金币+10, ★★★很有帮助 2016-10-11 13:12:21
xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-10-11 13:30:19
xn8008: 应助指数+1 2016-10-11 13:30:26

FDR为1，原因可能是：
1，样本量太少，很难得到有统计学意义的结果。
2. 样本测序质量太差。

其实，看差异表达的结果，并不一定使用FDR，很多参考文献都是使用p value值的。这个值虽然比较松，但是也有统计学意义。

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你，长大了吗？~有目的的希望小木虫不要倒闭

2楼2016-10-11 09:31:20

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银虫 (小有名气)

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xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-10-11 13:30:34

引用回帖:

2楼: Originally posted by xingzhou823 at 2016-10-11 09:31:20
FDR为1，原因可能是：
1，样本量太少，很难得到有统计学意义的结果。
2. 样本测序质量太差。

其实，看差异表达的结果，并不一定使用FDR，很多参考文献都是使用p value值的。这个值虽然比较松，但是也有统计学意 ...

样本量少是指平行样少吗？除了FDR，怎么看样本测序质量好坏呢？谢谢

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3楼2016-10-11 13:19:01

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