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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 如何在网上查找辣椒疫霉有关基因上下游序列，急
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qingchul

新虫 (小有名气)

[求助] 如何在网上查找辣椒疫霉有关基因上下游序列，急 已有1人参与

本人研究方向辣椒疫霉，准备做一个敲除，但是基因下游序列一直扩增不出来，在网上找不到，可能是我水平菜的问题，想请教各位虫友，你们一般怎样查找一个基因的下游序列，我在网上也百度了，很少有与疫霉相关的，谢谢
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1楼 2016-10-08 22:30:43
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木木不喜欢我

金虫 (正式写手)
★
kuaile5420: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-10-08 23:07:28
去ncbi找全基因组，然后定位基因，然后 下游，读文献看看有文献报道不

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2楼2016-10-08 22:45:53
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qingchul

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 木木不喜欢我 at 2016-10-08 22:45:53
去ncbi找全基因组，然后定位基因，然后 下游，读文献看看有文献报道不

多谢，想问一下，定位到基因之后，如何下游？
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3楼2016-10-08 22:52:46
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木木不喜欢我

金虫 (正式写手)
一般基因有在基因组的起始和结束位置，我以前做的植物，但不知道微生物这种环形的基因组怎么计算起始和结束的，然后知道后在全基因组就可以看到下游序列了

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4楼2016-10-08 23:00:01
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小冀-

版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★
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西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-10-09 22:34:42
ncbi里有，你找到这个菌的目的基因，点进去之后下边有一个图，那里会有该基因在基因组中的位置，表达方向和一些临近基因的信息

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···
5楼2016-10-08 23:06:13
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妞—潇洒

新虫 (正式写手)
gene词条里输入相关基因  进入之后能看到具体定位的位置 染色体什么的  然后下拉找到mapview  点genbank格式  通过调整显示上下游的碱基位置就能知道了

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我只管面朝大海，龇牙咧嘴，至于花爱开不开
6楼2016-10-09 18:30:41
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