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gaolt

金虫 (小有名气)

[求助] 知道一个基因是转录因子,如何预测其下游靶基因?已有2人参与

大家好!
                我现在做实验遇到了点生物信息上的问题,恳请大家帮忙。具体是我现在在做一个基因是转录因子,想做下游,怎么预测其下游靶基因?懂一点的请多帮帮忙谢谢!
                如有帮助定不胜感激!
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土豆君

银虫 (小有名气)

做ChIP-seq,可联系我
爱基百客,提供专业级ChIP-seq、ATAC-seq、MeRIP-seq、RIP-seq等表观技术服务
5楼2016-09-27 10:18:26
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yanzixiao

新虫 (初入文坛)


xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-09-26 23:55:53
对转录因子分析,看看属于那一大类,找到核心序列,再看转录因子调控的代谢通路,看看那些基因的启动子有可结和位点,方法比较麻烦也是概率事件,期待高人指点

发自小木虫Android客户端
2楼2016-09-26 23:19:30
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didongwei

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-09-26 23:56:12
xn8008: 应助指数+1 2016-09-26 23:56:22
xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-09-26 23:56:29
先确定结合位点,然后在全基因组中查找,在结合突变体分析。最可靠的是chlp实验

发自小木虫IOS客户端
不是优秀,而是不可替代
3楼2016-09-26 23:30:24
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lxzk

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
有条件的话ChIP-seq是最好的

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
4楼2016-09-27 04:44:05
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