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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 知道一个基因是转录因子，如何预测其下游靶基因？
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gaolt

金虫 (小有名气)

[求助] 知道一个基因是转录因子，如何预测其下游靶基因？ 已有2人参与

大家好！
                我现在做实验遇到了点生物信息上的问题，恳请大家帮忙。具体是我现在在做一个基因是转录因子，想做下游，怎么预测其下游靶基因？懂一点的请多帮帮忙谢谢！
                如有帮助定不胜感激！
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1楼 2016-09-26 20:55:33
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lxzk

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
有条件的话ChIP-seq是最好的

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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4楼2016-09-27 04:44:05
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yanzixiao

新虫 (初入文坛)
★
xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-09-26 23:55:53
对转录因子分析，看看属于那一大类，找到核心序列，再看转录因子调控的代谢通路，看看那些基因的启动子有可结和位点，方法比较麻烦也是概率事件，期待高人指点

发自小木虫Android客户端
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2楼2016-09-26 23:19:30
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didongwei

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-09-26 23:56:12
xn8008: 应助指数+1 2016-09-26 23:56:22
xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-09-26 23:56:29
先确定结合位点，然后在全基因组中查找，在结合突变体分析。最可靠的是chlp实验

发自小木虫IOS客户端
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不是优秀，而是不可替代
3楼2016-09-26 23:30:24
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土豆君

银虫 (小有名气)
做ChIP-seq，可联系我
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爱基百客，提供专业级ChIP-seq、ATAC-seq、MeRIP-seq、RIP-seq等表观技术服务
5楼2016-09-27 10:18:26
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