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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 双向测序得到拼接序列后怎么找到上下游引物
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呦吼吼

新虫 (初入文坛)

[求助] 双向测序得到拼接序列后怎么找到上下游引物 已有5人参与

新人，如标题，序列在1000bp以内，请介绍方法及相关软件，谢谢
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1楼 2016-09-21 21:06:02
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didongwei

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
kuaile5420: 金币+1, 鼓励发帖交流 2016-09-21 21:23:48
直接把测序序列粘贴到word上，然后把测序引物复制（ctrl+c），在测序序列中查找（ctrl+f）。有一条引物需要反向互补之后，再按相同方法查找即可

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不是优秀，而是不可替代
2楼2016-09-21 21:11:50
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010308Jing

木虫 (正式写手)
★
xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-09-24 07:47:35
有一个软件叫snapgene，不过要花钱，还有一个软件APE，可以试着用用序列比对，还不错，不需要自己肉眼看

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3楼2016-09-22 07:32:22
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-09-24 07:47:49
内容已删除
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4楼2016-09-22 15:48:41
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781055707

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
xn8008: 欢迎发帖交流 2016-09-24 07:47:55
DNAMAN.这是最普遍的，我们医院很多博士都用这个，楼主下了，自己学学吧。
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采菊东篱下，悠然见南山。
5楼2016-09-22 16:26:55
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sundan611

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-09-24 07:48:09
我用的最笨的方法 把拼接好的序列粘贴到word里 然后用查找功能  输入引物 或是引物的一段序列 就可以找到了
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6楼2016-09-23 11:30:50
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915191677

金虫 (小有名气)
★
xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-09-24 07:48:16
就看序列的软件Chromas 就可以的  实在不行就转换成FASTA格式用MEGA 和DNAMAN也可以。

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7楼2016-09-23 11:45:08
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小六合

铁虫 (初入文坛)
★
xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-09-24 07:48:21
用txt就可以找得到，用primer拼接保存序列

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8楼2016-09-23 12:20:28
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kungfu2016

新虫 (正式写手)
xn8008: 欢迎发帖交流 2016-09-24 07:48:26
使用Find功能

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9楼2016-09-23 18:43:52
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ljsrzc

木虫 (正式写手)

喜欢海贼王喜欢娜美喜欢汉库克
★
xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-09-24 07:48:37
哈哈哈，看这些回答想笑

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在一家试剂公司，买科研产品找我哦q2229097569
10楼2016-09-23 20:15:45
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