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prthefu

木虫 (著名写手)

[交流] 蛋白跑PAGE,发现上清、沉淀都有目的带,怎么解 已有6人参与

某蛋白,原核表达,带His标签。  氨基酸理论预测分子量约32kDa,加上his标签的大小,应该对条带位置影响不大吧。
1、跑PAGE后,图1,发现重组菌的上清、沉淀在对应大小出都出现了目的条带(35下面),现在也不确定到底是哪个条带,是沉淀处较浅的那个单一带还是上清中稍微有些上翻的带。
2、分析蛋白疏水性的时候,图2,得出的值是MIN: -3.289, MAX: 2.656 ,这应该说明该蛋白偏亲水性大于疏水性,而且,由图知,两边亲水,中间疏水,但是整体来说,蛋白是亲水还是疏水呢?确定了它是亲水还是疏水,是不是就知道上清or沉淀的带是目的条带。
3、关于纯化,如果过镍柱,洗脱得到的管中有很多盐,并不是纯化的蛋白,过柱后还这么做呢。

蛋白跑PAGE,发现上清、沉淀都有目的带,怎么解
图2.png


蛋白跑PAGE,发现上清、沉淀都有目的带,怎么解-1
图1.png
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bright8

铁杆木虫 (著名写手)

很正常了,大部分蛋白用原核表达系统,都是包涵体居多,上清很少了。

发自小木虫Android客户端
9楼2016-09-23 23:26:31
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hc-material

专家顾问 (职业作家)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
没明白你要描述的啥问题。
1.破碎后上清沉淀都有目标很正常,确定那个是目标蛋白条带可以用没诱导的菌跑电泳对照,会很明显。
破碎后上清沉淀都有目标,有各种可能,比如菌没破碎彻底,有部分是包涵体表达,还有破碎的沉淀没洗等,都有可能是电泳结果呈现出上清沉淀都有蛋白的现象。
过柱后盐描述的啥问题没太清楚,过镍柱后,洗脱里面有杂质也正常,可以拉梯度洗脱,镍柱后或前也可以在加其他的层析,比如离子或疏水的。
洗脱液中盐的去处可以超滤,过葡聚糖凝胶G25层析分离都可以。祝顺利。
2楼2016-09-20 14:28:48
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prthefu

木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by hc-material at 2016-09-20 14:28:48
没明白你要描述的啥问题。
1.破碎后上清沉淀都有目标很正常,确定那个是目标蛋白条带可以用没诱导的菌跑电泳对照,会很明显。
破碎后上清沉淀都有目标,有各种可能,比如菌没破碎彻底,有部分是包涵体表达,还有破 ...

我想问,根据我提供的蛋白疏水性分析,能确定该蛋白是亲水的吗?
另外,在破碎时,超声近半个小时,应该够彻底了吧,所以,沉淀还有带,那是包涵体吗?
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3楼2016-09-20 14:55:20
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milamiya

禁虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
本帖内容被屏蔽

4楼2016-09-21 17:37:34
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