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时光检索金虫 (小有名气)
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提问：小RNA
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做拟南芥micro-RNA测序，提供样品，公司建库，测序。第一次，长度分布图显示30-40nt的较多，测序比对结果都显示与已知RNA比对率低3%-5%（mapping率低？）。公司怀疑我们实验室自己抽提的RNA质量不好。第二次直接植物样品，结果长度分布正常了，但是测序比对结果都显示与已知RNA比对率低10%左右。实验组，对照组都有重复，都是这个结果。 请问：这最有可能是哪步出问题了？测出来很多未知的正常吗？这样的结果正常吗？拟南芥正常的mapping率在多少结果正常呢？ 十分感谢，希望大家给出宝贵建议  图片2.png  图片1.png@biostar2009@飞约疯人院 |
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