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小~可木虫 (小有名气)
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【求助】forcite中的构型优化后的能量问题
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用forcite进行构型优化，力场：compass，status.txt文件中总能量是指什么？用discover，能量最小化得到的是势能最小值，那用forcite构型优化得到的是什么能量？ Geometry optimization status Iteration: 5 Total energy : 214.074714 kcal/mol Contributions to total energy (kcal/mol): Valence energy (diag. terms) : 39.681 Bond : 30.783 Angle : 73.754 Torsion : -65.418 Inversion : 0.562 Valence energy (cross terms) : -54.130 Stretch-Stretch : 1.814 Stretch-Bend-Stretch : 0.517 Stretch-Torsion-Stretch : -1.940 Separated-Stretch-Stretch : 1.002 Torsion-Stretch : -46.804 Bend-Bend : -0.836 Torsion-Bend-Bend : 4.808 Bend-Torsion-Bend : -12.691 Non-bond energy : 228.524 Hydrogen bond : 0.000 van der Waals : 85.565 Electrostatic : 142.959 另一个txt文件中优化后的能量又是什么呢，为什么优化的是同一个分子，能量不一样呢？ ---- Final structure ---- Total energy : 68.489559 kcal/mol Contributions to total energy (kcal/mol): Valence energy (diag. terms) : 42.816 Bond : 36.752 Angle : 77.930 Torsion : -72.593 Inversion : 0.727 Valence energy (cross terms) : -63.267 Stretch-Stretch : 1.316 Stretch-Bend-Stretch : 3.179 Stretch-Torsion-Stretch : -3.332 Separated-Stretch-Stretch : 0.863 Torsion-Stretch : -53.775 Bend-Bend : -0.828 Torsion-Bend-Bend : 4.671 Bend-Torsion-Bend : -15.361 Non-bond energy : 88.941 Hydrogen bond : 0.000 van der Waals : 26.246 Electrostatic : 62.695 [ Last edited by 小~可 on 2008-11-22 at 18:21 ] |
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