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小~可

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】forcite中的构型优化后的能量问题

用forcite进行构型优化,力场:compass,status.txt文件中总能量是指什么?用discover,能量最小化得到的是势能最小值,那用forcite构型优化得到的是什么能量?



Geometry optimization status

Iteration:     5

Total energy                    : 214.074714 kcal/mol

Contributions to total energy (kcal/mol):
  Valence energy (diag. terms)  :    39.681
    Bond                        :    30.783
    Angle                       :    73.754
    Torsion                     :   -65.418
    Inversion                   :     0.562
  Valence energy (cross terms)  :   -54.130
    Stretch-Stretch             :     1.814
    Stretch-Bend-Stretch        :     0.517
    Stretch-Torsion-Stretch     :    -1.940
    Separated-Stretch-Stretch   :     1.002
    Torsion-Stretch             :   -46.804
    Bend-Bend                   :    -0.836
    Torsion-Bend-Bend           :     4.808
    Bend-Torsion-Bend           :   -12.691
  Non-bond energy               :   228.524
    Hydrogen bond               :     0.000
    van der Waals               :    85.565
    Electrostatic               :   142.959


另一个txt文件中优化后的能量又是什么呢,为什么优化的是同一个分子,能量不一样呢?
---- Final structure ----

Total energy                    : 68.489559 kcal/mol

Contributions to total energy (kcal/mol):
  Valence energy (diag. terms)  :    42.816
    Bond                        :    36.752
    Angle                       :    77.930
    Torsion                     :   -72.593
    Inversion                   :     0.727
  Valence energy (cross terms)  :   -63.267
    Stretch-Stretch             :     1.316
    Stretch-Bend-Stretch        :     3.179
    Stretch-Torsion-Stretch     :    -3.332
    Separated-Stretch-Stretch   :     0.863
    Torsion-Stretch             :   -53.775
    Bend-Bend                   :    -0.828
    Torsion-Bend-Bend           :     4.671
    Bend-Torsion-Bend           :   -15.361
  Non-bond energy               :    88.941
    Hydrogen bond               :     0.000
    van der Waals               :    26.246
    Electrostatic               :    62.695

[ Last edited by 小~可 on 2008-11-22 at 18:21 ]
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zw671588

金虫 (小有名气)

我也遇到这个问题,非常疑惑
3楼2009-05-19 07:52:14
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