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kdcandy

木虫 (小有名气)

[求助] gromacs中compressibility的问题 已有1人参与

gromacs中compressibility的问题

; Pressure coupling     
Pcoupl                   = Parrinello-Rahman
Pcoupltype               = anisotropic
; Time constant (ps), compressibility (1/bar) and reference P (bar)
;tau_p                    = 2 2 2 2 2 2
compressibility          = 4.5e-5 4.5e-5 4.5e-5 4.5e-5 4.5e-5 4.5e-5 4.5e-5
ref_p                    = 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0

想问一下如果我的体系是粗粒化的体系我的compressibility应该怎么设置?
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brucefan

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【答案】应助回帖

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kdcandy: 金币+10, 有帮助 2016-09-20 08:51:02
就是这个材料的压缩常数。其实不用太准确,大致对就行。这个值设置太高,压强涨落会较大,反之较小。just try and error。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
2楼2016-09-20 01:12:42
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