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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 【求助】用什么方法计算团簇的光学性质？
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151749364

[交流] 【求助】用什么方法计算团簇的光学性质？

如题  
导师让我用CASTEP计算团簇的光学性质
但是大家知道  CASTEP  只能用来计算周期性体系
那么  该对团簇模型进行什么样的操作才能计算呢？

[ Last edited by freshgirl on 2009-6-25 at 18:36 ]
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1楼 2008-11-21 11:38:34
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zdhlover

荣誉版主 (职业作家)

小木虫之莲花佛
★ ★ ★
spur(金币+2,VIP+0):^_^ 3Q！！欢迎常来！
151749364(金币+1,VIP+0):谢谢了
给你个我的独门诀窍啊：把你要研究的团簇放在一个你的团簇的直径+10埃的立方空结构的中间位置，计算一下就可以了，(或者你用Domol3计算，这个是笔误，本来想说win2k可以计算光学性质的，而且计算结果比较可靠准确的）

[ Last edited by zdhlover on 2008-11-22 at 20:34 ]
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2楼2008-11-21 11:56:03
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151749364

你的意思是不是先构建一个立体的空间格子  然后将所要计算的团簇体系粘帖到这个立方格子里面  再用CASTEP计算？
我试了一下  这样算应该可以的   那请教一下 ：  计算的时候是否需要超晶胞？ 因为我发现虽然团簇原子个数是正确的  但这些原子会杂乱分布在格子里   只有超晶胞的条件下才可看出具体的形状   另外  计算的时候原子之间的键用加上吗？
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3楼2008-11-21 15:32:03
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zdhlover

荣誉版主 (职业作家)

小木虫之莲花佛
★
jghe(金币+1,VIP+0):感谢你参与讨论！
你已经明白了我的意思了，建个超晶胞也可以，不过按我个人理解：如果你确实是把你要研究的团簇放在一个你的团簇的直径+10埃的立方空结构的正中间位置，应该不会散乱的，当然如果散乱了你可以试着建一个你的团簇的直径+12埃的立方空结构，把团簇一定要放在这个立方空结构的正中间位置，说白了，为什么要加10埃、12埃是为了避免Castep做周期性计算的两个相邻格子里的团簇的原子有相互作用，但是你的格子建的太大了计算量就增加的多，一般以10埃左右就可以了，如果不能正确显示形状，你加大晶格参数，使两个相邻团簇的距离足够大肯定可以正确显示的，至于键我认为可以不用加
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4楼2008-11-21 15:49:03
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jghe

金虫 (著名写手)
★
fegg7502(金币+1,VIP+0):以资奖励
这样算的跟学性质跟孤立体系的应该不一样的，具体有什么联系我也不懂。 如果要算孤立体系光学性质最好用Dmol3 或gaussian03
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5楼2008-11-21 20:31:02
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zdhlover

荣誉版主 (职业作家)

小木虫之莲花佛
★
fegg7502(金币+1,VIP+0):以资奖励
楼上的你可以试一下，其实是一样，只要你做的体系相邻的间隔足够大，表面上方取10埃的真空与这样建模可以类比的,而且Castep的帮助文件里有的，他说的就是建超胞

[ Last edited by zdhlover on 2008-11-21 at 20:46 ]
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6楼2008-11-21 20:36:05
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awpsr

金虫 (正式写手)

快快乐乐小青虫
引用回帖:
Originally posted by zdhlover at 2008-11-21 11:56:
给你个我的独门诀窍啊：把你要研究的团簇放在一个你的团簇的直径+10埃的立方空结构的中间位置，计算一下就可以了，或者你用Domol3计算

DMOl3如合计算光学性质，请指教
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世上本没有人， 路走多了便成了人
7楼2008-11-21 21:48:46
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canbill

银虫 (小有名气)
★
fegg7502(金币+1,VIP+0):以资奖励
DMOl3好像不能算光学性质吧？
另外，把团簇放到立方格子里面可以认为是整个模型具有周期结构，这个模型就和团簇随机排列的模型不同，因此两个模型的光学性质就应该不同。
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8楼2008-11-23 09:56:59
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zdhlover

荣誉版主 (职业作家)

小木虫之莲花佛
★ ★
spur(金币+2,VIP+0): 3Q！！谢谢参与！欢迎常来！
您好，本身团簇你可以先用其他软件优化确定结构之后再算，不晓得你的团簇的随机排列是什么意思，如果本身结构就不确定你用什么软件都算不了
另外：1，由于团簇本身是非周期性的，为了计算才把它放在具有周期性周围是真空的格子里计算的，castep的软件说明书里有这样的说明的，其次这样的做法可以同表面类比，表面是不具有周期性的，但是加了真空就可以算了
2，因为周围加了足够大的真空，相邻团簇的原子之间是没有相互作用的，所以各个团簇可以看作是独立（其实我们只研究了一个团簇）的

[ Last edited by zdhlover on 2008-11-23 at 10:30 ]
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9楼2008-11-23 10:17:30
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151749364

引用回帖:
Originally posted by zdhlover at 2008-11-23 10:17:
您好，本身团簇你可以先用其他软件优化确定结构之后再算，不晓得你的团簇的随机排列是什么意思，如果本身结构就不确定你用什么软件都算不了
另外：1，由于团簇本身是非周期性的，为了计算才把它放在具有周期性周 ...

谢谢你给我的答复。
我算的团簇首先用了Dmol3几何优化，得到了能量最小结构；
现在我可以得到一个在空间格子里的完整团簇模型，那我经过CASTEP光学性质计算时，总是不能够计算成功，结果文件显示尽管SCF步已经完成，但是无法达到基态，在增加完SCF步以后，错误信息仍然显示
请教一下，该更改什么设置才可以获得基态并使光学性质的计算成功呢？
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10楼2008-11-23 22:19:42
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