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151749364

[交流] 【求助】用什么方法计算团簇的光学性质?

如题  
导师让我用CASTEP计算团簇的光学性质
但是大家知道  CASTEP  只能用来计算周期性体系
那么  该对团簇模型进行什么样的操作才能计算呢?

[ Last edited by freshgirl on 2009-6-25 at 18:36 ]
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zdhlover

荣誉版主 (职业作家)

小木虫之莲花佛

★ ★ ★
spur(金币+2,VIP+0):^_^ 3Q!!欢迎常来!
151749364(金币+1,VIP+0):谢谢了
给你个我的独门诀窍啊:把你要研究的团簇放在一个你的团簇的直径+10埃的立方空结构的中间位置,计算一下就可以了,(或者你用Domol3计算,这个是笔误,本来想说win2k可以计算光学性质的,而且计算结果比较可靠准确的)

[ Last edited by zdhlover on 2008-11-22 at 20:34 ]
2楼2008-11-21 11:56:03
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151749364

你的意思是不是先构建一个立体的空间格子  然后将所要计算的团簇体系粘帖到这个立方格子里面  再用CASTEP计算?
我试了一下  这样算应该可以的   那请教一下 :  计算的时候是否需要超晶胞? 因为我发现虽然团簇原子个数是正确的  但这些原子会杂乱分布在格子里   只有超晶胞的条件下才可看出具体的形状   另外  计算的时候原子之间的键用加上吗?
3楼2008-11-21 15:32:03
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zdhlover

荣誉版主 (职业作家)

小木虫之莲花佛


jghe(金币+1,VIP+0):感谢你参与讨论!
你已经明白了我的意思了,建个超晶胞也可以,不过按我个人理解:如果你确实是把你要研究的团簇放在一个你的团簇的直径+10埃的立方空结构的正中间位置,应该不会散乱的,当然如果散乱了你可以试着建一个你的团簇的直径+12埃的立方空结构,把团簇一定要放在这个立方空结构的正中间位置,说白了,为什么要加10埃、12埃是为了避免Castep做周期性计算的两个相邻格子里的团簇的原子有相互作用,但是你的格子建的太大了计算量就增加的多,一般以10埃左右就可以了,如果不能正确显示形状,你加大晶格参数,使两个相邻团簇的距离足够大肯定可以正确显示的,至于键我认为可以不用加
4楼2008-11-21 15:49:03
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jghe

金虫 (著名写手)


fegg7502(金币+1,VIP+0):以资奖励
这样算的跟学性质跟孤立体系的应该不一样的,具体有什么联系我也不懂。 如果要算孤立体系光学性质最好用Dmol3 或gaussian03
5楼2008-11-21 20:31:02
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zdhlover

荣誉版主 (职业作家)

小木虫之莲花佛


fegg7502(金币+1,VIP+0):以资奖励
楼上的你可以试一下,其实是一样,只要你做的体系相邻的间隔足够大,表面上方取10埃的真空与这样建模可以类比的,而且Castep的帮助文件里有的,他说的就是建超胞

[ Last edited by zdhlover on 2008-11-21 at 20:46 ]
6楼2008-11-21 20:36:05
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awpsr

金虫 (正式写手)

快快乐乐小青虫

引用回帖:
Originally posted by zdhlover at 2008-11-21 11:56:
给你个我的独门诀窍啊:把你要研究的团簇放在一个你的团簇的直径+10埃的立方空结构的中间位置,计算一下就可以了,或者你用Domol3计算

DMOl3如合计算光学性质,请指教
世上本没有人, 路走多了便成了人
7楼2008-11-21 21:48:46
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canbill

银虫 (小有名气)


fegg7502(金币+1,VIP+0):以资奖励
DMOl3好像不能算光学性质吧?
另外,把团簇放到立方格子里面可以认为是整个模型具有周期结构,这个模型就和团簇随机排列的模型不同,因此两个模型的光学性质就应该不同。
8楼2008-11-23 09:56:59
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zdhlover

荣誉版主 (职业作家)

小木虫之莲花佛

★ ★
spur(金币+2,VIP+0): 3Q!!谢谢参与!欢迎常来!
您好,本身团簇你可以先用其他软件优化确定结构之后再算,不晓得你的团簇的随机排列是什么意思,如果本身结构就不确定你用什么软件都算不了
另外:1,由于团簇本身是非周期性的,为了计算才把它放在具有周期性周围是真空的格子里计算的,castep的软件说明书里有这样的说明的,其次这样的做法可以同表面类比,表面是不具有周期性的,但是加了真空就可以算了
2,因为周围加了足够大的真空,相邻团簇的原子之间是没有相互作用的,所以各个团簇可以看作是独立(其实我们只研究了一个团簇)的

[ Last edited by zdhlover on 2008-11-23 at 10:30 ]
9楼2008-11-23 10:17:30
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151749364

引用回帖:
Originally posted by zdhlover at 2008-11-23 10:17:
您好,本身团簇你可以先用其他软件优化确定结构之后再算,不晓得你的团簇的随机排列是什么意思,如果本身结构就不确定你用什么软件都算不了
另外:1,由于团簇本身是非周期性的,为了计算才把它放在具有周期性周 ...

谢谢你给我的答复。
我算的团簇首先用了Dmol3几何优化,得到了能量最小结构;
现在我可以得到一个在空间格子里的完整团簇模型,那我经过CASTEP光学性质计算时,总是不能够计算成功,结果文件显示尽管SCF步已经完成,但是无法达到基态,在增加完SCF步以后,错误信息仍然显示
请教一下,该更改什么设置才可以获得基态并使光学性质的计算成功呢?
10楼2008-11-23 22:19:42
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