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熊猫爱吃竹子

新虫 (小有名气)

[求助] 大提质粒时如何提高质粒浓度? 已有7人参与

用thermo的试剂盒从150ml菌液中提质粒,最后用nano测只有200多ng/ml,别人一般都能提到900ng/ml左右,请问一下有什么需要注意的地方吗,在操作过程中?谢谢

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匿名

用户注销 (著名写手)


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-09-22 22:22:37
本帖仅楼主可见
13楼2016-09-22 22:16:47
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特洛克

新虫 (初入文坛)


【答案】应助回帖

质粒提取,不但困扰了好些新手,而且不少老手提取质粒也不稳定。
影响质粒产量的因素很多,现列举部分,望同道中人完善。

1、质粒本身:高拷贝还是低拷贝,影响特别大。低拷贝的特定质粒可以考虑加氯霉素提高拷贝数(建议先了解氯霉素提高质粒拷贝数的原理,应该不是所有的都有效,可能起到相反效果)。
2. 宿主菌:常用的DH5α等,有利于得到高产量的质粒。另外一些菌种效果可能差很多(同一实验室用相同菌种,若别人得率高,应该可以排除这个原因)。
3. 摇菌时间:这个影响非常大!有一些实验者在这方面做得很不好。建议摇菌12-16小时,时间过短,单个菌体中的质粒拷贝数会低很多!时间过长,当心细菌可能死亡,导致基因组污染等问题。特殊菌种、特殊摇菌温度,时间需另行把握。
4. 摇菌用容器大小:这个影响也是比较大的。摇150ml的菌液,应该用500ml以上的摇菌瓶,效果比250ml或以下的要好。基本原则是摇菌容器的体积是菌液体积的4倍或以上。
5. 菌种来源:新转化的菌种比冻存菌液要好。
6. 培养基:应该用高品质新配置的培养基。
7. 菌液用量:恰当最好,宁少勿多。必须确保充分裂解,否则产量和纯度会显著降低。
8. 质粒提取试剂盒的因素:现在市场上质粒提取试剂盒很多,鱼龙混杂。好些号称高产、高纯度无内毒素大提,实际产量和纯度堪忧。OD260判断浓度、OD260/OD280和OD260/OD230比值判断纯度,很多时候并不客观。好些情况下,杂质含量高,OD260、280、230差不多按比例升高,比值好并不代表纯度就一定好、建议进一步琼脂糖胶电泳。(同一实验同一试剂盒,可排除这方面因素)。
9. 其它因素:待大家补充。
14楼2016-09-27 17:46:58
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普通回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-09-22 22:20:17
我们大提质粒是自己配试剂直接用碱裂解法提,用的15ml离心管。试剂盒中吸附柱挂载量有限,你可以前面步骤用试剂盒的试剂,不要过柱,用无水乙醇沉淀,得率应该会提高。
2楼2016-09-18 01:08:51
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liling0601

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我们用的天根的试剂盒,150ML的菌液一般能抽1mg左右
3楼2016-09-18 11:27:11
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010308Jing

木虫 (正式写手)

其实这个跟质粒还是有关系的,你保留点之前的菌液直接扩大会比重新挑克隆好很多

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4楼2016-09-18 11:55:55
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花花贝

金虫 (知名作家)

引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2016-09-18 01:08:51
我们大提质粒是自己配试剂直接用碱裂解法提,用的15ml离心管。试剂盒中吸附柱挂载量有限,你可以前面步骤用试剂盒的试剂,不要过柱,用无水乙醇沉淀,得率应该会提高。

纯吗?

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5楼2016-09-19 22:03:23
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rhjilio

新虫 (小有名气)

同意乙醇沉淀那个方法试试

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6楼2016-09-20 07:19:41
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yuy111

银虫 (正式写手)


【答案】应助回帖

We used QIAGEN for Maxi prep for tissue culture . I wonder what was the problem in your work.
Homemade DNA may not be good enough for some purpose.
7楼2016-09-20 07:28:39
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by 花花贝 at 2016-09-19 22:03:23
纯吗?
...

还可以,你大提质粒是要做什么后续试验?
8楼2016-09-20 12:39:57
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zhen022

新虫 (正式写手)

多摇一些细菌,离心后重悬再烈解

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9楼2016-09-20 13:01:05
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花花贝

金虫 (知名作家)

引用回帖:
8楼: Originally posted by stone2239 at 2016-09-20 12:39:57
还可以,你大提质粒是要做什么后续试验?...

转染啊

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10楼2016-09-20 13:22:09
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