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majun04

木虫 (著名写手)

majun

[交流] 【求助】金币换取有离子参加的化学反应过渡态的计算实例

用Gaussian03做有正价离子(氢离子或者金属离子)催化的化学反应,在寻找反应路径中的过渡态。

目前困难:
游离的氢离子和乙腈作用,氢离子和氮原子成键过渡态找不到。成键后的稳定态已经找到。但是乙腈和氢离子在同一个文件中优化怎么也不收敛,改变方法依然没有找到。因此用QST2方法找,不成功。自己设计过渡态优化结果不收敛,要么502错误,要么氢优化过程中,和氮原子成键(回到定点,并非过渡态)。

求助内容:
提供金属离子(或者氢离子)与有机物分子在同一个文件中优化的方法。在此状况下离子和分子并没有任何相互作用,仅仅是为了读取能量基点(或者方便用于QST2方法的输入文件)。
提供有氢离子或者金属离子(带正电荷的)参与的催化反应中,金属离子(或者氢离子)与反应物成键(或者断键),过渡态的寻找方法。
最好是提供具体的命令参数

调试很久依然没有成功,请高手帮忙!重金答谢!
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乐观、执着、勤奋
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dolphin618

金虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★
majun04(金币+3,VIP+0):谢谢你!
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢
引用回帖:
Originally posted by majun04 at 2008-11-21 09:16:


这个就是在做《基础有机化学》(邢其毅)上册,540页的酸催化乙腈水解的机理呢。

所以你是在first step 就出现问题了? 质子化的过程一定存在过渡态吗,我觉得不一定吧,另外就是你可以用H3O+ 代替H+ 试一下
生命本就是不可名说的缘法,可又有谁愿做菩提下微笑拈起的莲花?
6楼2008-11-22 04:37:23
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jqhejia

银虫 (正式写手)

★ ★
majun04(金币+1,VIP+0):谢谢你,尝试了,不行的。
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢
用QST2方法找过渡态,不如改用qst3试试,成功几率大些
2楼2008-11-20 23:15:43
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3楼2008-11-21 00:30:52
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dolphin618

金虫 (正式写手)


zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
你这个是气相中的反应吗?有没有想过用水合氢离子代替氢离子呢
生命本就是不可名说的缘法,可又有谁愿做菩提下微笑拈起的莲花?
4楼2008-11-21 04:41:25
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