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weirdong

金虫 (小有名气)

[求助] PCR数据处理 已有2人参与

各位师兄师姐，本人初学PCR，做的主要是检测RNA在病人癌组织和癌旁组织的表达差异，做了癌组织的目的基因、内参基因，还有癌旁组织的目的基因、内参基因，网上看到对于RNA的相对定量分析有好几种，2^-△△Ct方法最常用，可以算出倍数变化，但是不知道发文章用的图用的是怎么么做的，以柱状图还是以什么图表示呢，例如我上传的图片，这个是两种RNA在癌和癌旁的表达，这副图反应的是什么，是什么软件做的（小点点和拔值），为什么两个图纵坐标不一样，谢谢！

PCR数据处理
PCR作图.png
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1楼 2016-08-30 11:33:56
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1234why5678

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
一般图是用GraphPad做的，发文章用什么图，你检索几篇相关文献看看就知道了，你发的图也可以用这个软件做的，应该就是两种RNA分别在癌组织和癌旁组织内的表达情况，纵坐标是表示相对表达情况，纵坐标不同就是因为这两种RNA在癌组织和癌旁组织的表达情况不同，左图的表达含量更高（没看到文章，不知道是癌组织还是癌旁组织），两种RNA中T(RQ)的表达含量更高
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2楼2016-09-01 09:13:30
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xiaoxiaox17

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

用Graphpad就可以做出来，各个点是得出的不同数值，你po的这个图是log10(RQ)不是2^-△△Ct，在graph里双击你要做的这个图（一开始都是bar图，双击这个bar）设置中‘style’的‘appearance’改为'scatter dot plot'就可以了，这个SD是自动算的你都不用管
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Nicetomeetyou
3楼2016-09-06 08:25:56
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