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weirdong

金虫 (小有名气)

[求助] PCR数据处理 已有2人参与

各位师兄师姐,本人初学PCR,做的主要是检测RNA在病人癌组织和癌旁组织的表达差异,做了癌组织的目的基因、内参基因,还有癌旁组织的目的基因、内参基因,网上看到对于RNA的相对定量分析有好几种,2^-△△Ct方法最常用,可以算出倍数变化,但是不知道发文章用的图用的是怎么么做的,以柱状图还是以什么图表示呢,例如我上传的图片,这个是两种RNA在癌和癌旁的表达,这副图反应的是什么,是什么软件做的(小点点和拔值),为什么两个图纵坐标不一样,谢谢!

PCR数据处理
PCR作图.png
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xiaoxiaox17

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

用Graphpad就可以做出来,各个点是得出的不同数值,你po的这个图是log10(RQ)不是2^-△△Ct,在graph里双击你要做的这个图(一开始都是bar图,双击这个bar)设置中‘style’的‘appearance’改为'scatter dot plot'就可以了,这个SD是自动算的你都不用管
Nicetomeetyou
3楼2016-09-06 08:25:56
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1234why5678

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
一般图是用GraphPad做的,发文章用什么图,你检索几篇相关文献看看就知道了,你发的图也可以用这个软件做的,应该就是两种RNA分别在癌组织和癌旁组织内的表达情况,纵坐标是表示相对表达情况,纵坐标不同就是因为这两种RNA在癌组织和癌旁组织的表达情况不同,左图的表达含量更高(没看到文章,不知道是癌组织还是癌旁组织),两种RNA中T(RQ)的表达含量更高
2楼2016-09-01 09:13:30
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