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银虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】活性位点定位方法请教

在做分子对接前，如果不能确定活性位点，用什么方法可以找到可能的活性区域。
直接用对接软件blind-dock的方法找到的区域，和用其他一些软件预测的区域有些不同，请高手指教

[ Last edited by zdhlover on 2009-12-14 at 14:19 ]

1楼 2008-11-17 16:26:00

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金虫 (小有名气)

★
mingdong(金币+1,VIP+0):谢谢您的帮助

可以试试本人开发的两个websever, 一个是蛋白小分子的结合位点的预测，一个是蛋白-蛋白相互作用位点。
http://scoppi.biotec.tu-dresden.de/pocket
http://scoppi.biotec.tu-dresden.de/metappi

3楼2009-01-04 05:06:12

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木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢

对于活性位点的搜寻是一种专门的算法，对于此有很多软件，我用过的有InsightII/active site search，Autodock的blind dock，但是算出来的毕竟是算出来的，不一定能保证对每个蛋白都百分之百的准确，其成功率及准确率也同样取决于你的蛋白表面特征

个人博客：[url]http://blog.sina.com.cn/gaiwei[/url]

2楼2008-11-18 20:29:28

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