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风随心动

铜虫 (小有名气)

[求助] 请问上传质粒信息到NCBI上时,怎样制作fasta文件啊?求助fasta文件模板一份。谢谢 已有1人参与

请教一下,上传质粒信息到NCBI上时,怎样制作fasta文件啊?求助fasta文件模板一份。谢谢大家。
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偶见繁星梦九天,只愿沧海桑田始如先。
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陈楠19920225

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-08-21 21:52:25
xn8008: 应助指数+1 2016-08-22 07:52:52
风随心动: 金币+5, ★★★很有帮助 2016-08-22 10:37:01
我做过fasta文件,但不知适不适用你这个,你可以试试。下载个bioidet,把你的信息保存在文本文件中,用软件打开,保存为fasta格式。你试一试看好用不

发自小木虫Android客户端
2楼2016-08-21 17:33:42
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风随心动

铜虫 (小有名气)


xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-08-22 07:52:47
引用回帖:
2楼: Originally posted by 陈楠19920225 at 2016-08-21 17:33:42
我做过fasta文件,但不知适不适用你这个,你可以试试。下载个bioidet,把你的信息保存在文本文件中,用软件打开,保存为fasta格式。你试一试看好用不

请问你知道fasta里要有质粒的哪些信息吗?
偶见繁星梦九天,只愿沧海桑田始如先。
3楼2016-08-21 17:43:51
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山水88

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
风随心动: 金币+25, ★★★很有帮助 2016-08-22 10:36:45
内容已删除
4楼2016-08-22 10:32:59
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风随心动

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 山水88 at 2016-08-22 10:32:59
下面是格式要求,txt中写好后改文件后缀为fasta即可

fasta序列格式是blast组织数据的基本格式,无论是数据库还是查询序列,大多数情况都使用fasta序列格式,所以首先对fasta格式在做详细说明。

下面是一个来源 ...

你好,谢谢,我不是要比对序列,我是要上传质粒到genbank上去。
偶见繁星梦九天,只愿沧海桑田始如先。
5楼2016-08-22 10:37:11
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山水88

木虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 风随心动 at 2016-08-22 10:37:11
你好,谢谢,我不是要比对序列,我是要上传质粒到genbank上去。...

按照格式要求制作fasta文件就可以了呀,这个文件没有质粒的详细信息,主要是名称和序列就行了
6楼2016-08-22 12:30:11
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tangbowen

新虫 (小有名气)

7楼2016-08-23 23:57:28
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风随心动

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by tangbowen at 2016-08-23 23:57:28
NCBI上有模版的

谢谢。
偶见繁星梦九天,只愿沧海桑田始如先。
8楼2016-08-24 18:40:08
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