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csutzk

木虫 (小有名气)


[交流] 在做纳米颗粒的烧结仿真,有几个问题想和大家讨论一下。 已有2人参与

建好了Ag纳米颗粒,然后用movement和copy的方法把两个大小分别为30A和10A的纳米颗粒放到了一个窗口,图一
然后按照图3选择NVT系综,然后取步长跑出来,小的纳米颗粒几乎都扩散了,而我想要的是烧结成型过程,我认为这个结果只是融化了,因为时间问题,所以大的颗粒扩散融化慢一些,但是图3的窗口中不能施加压力。想请问如何施加压力,或者给这个过程添加边界条件?谢谢了
还有如何利用分子动力学中的一些方法获得模型的初始参数,比如用EAM势能计算原子间相互作用势等。

在做纳米颗粒的烧结仿真,有几个问题想和大家讨论一下。
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在做纳米颗粒的烧结仿真,有几个问题想和大家讨论一下。-1
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MS_Z

金虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
同为novice,不知道回答能不能帮到你。你既然选择了NVT ensemble,那么这个体系的压力就是根据具体每一个时刻模拟体系内原子的动量等信息可以算出的。如果你还要添加压力的条件:那么这个模拟就变成NVTP,体系应该就没有自由度了,模拟也就进行不了吧。

发自小木虫IOS客户端
2楼2016-08-18 16:28:27
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csutzk

木虫 (小有名气)


引用回帖:
2楼: Originally posted by MS_Z at 2016-08-18 16:28:27
同为novice,不知道回答能不能帮到你。你既然选择了NVT ensemble,那么这个体系的压力就是根据具体每一个时刻模拟体系内原子的动量等信息可以算出的。如果你还要添加压力的条件:那么这个模拟就变成NVTP,体系应该就 ...

对,你说的很有道理。我再试试,希望可以多多交流。。谢谢
3楼2016-08-18 16:48:53
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leebrave

银虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
首先,你要做一个盒子,三维周期性的,才能有npt的系综。
其次,你的温度设置的不够,才400k?  也就100摄氏度吖,怎们烧结?
最后,不太看好用同种的粒子烧结,没法分析分辨,最好用两种粒子。
还有,根据文献中的,最好是你做一个基底,在基底上进行烧结最好。
不慌,平常心,一步一步走过来。
6楼2016-08-18 18:02:28
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csutzk

木虫 (小有名气)


引用回帖:
14楼: Originally posted by leebrave at 2016-08-19 09:20:17
不应该啊,你也可以直接在你的分子那个界面上建造盒子,把显示的方式调解下就好...

用你所说的,在模型界面上建造了一个盒子就用的build 下的crystals。出现了NPT,但是结果不扩散也没结合。是不是需要边界条件,MS是他是自动选择计算么?不需要你选择计算势能,或者初速度的计算方式么?
在做纳米颗粒的烧结仿真,有几个问题想和大家讨论一下。-3
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在做纳米颗粒的烧结仿真,有几个问题想和大家讨论一下。-4
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15楼2016-08-19 11:51:46
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普通回帖

csutzk

木虫 (小有名气)


引用回帖:
2楼: Originally posted by MS_Z at 2016-08-18 16:28:27
同为novice,不知道回答能不能帮到你。你既然选择了NVT ensemble,那么这个体系的压力就是根据具体每一个时刻模拟体系内原子的动量等信息可以算出的。如果你还要添加压力的条件:那么这个模拟就变成NVTP,体系应该就 ...

对,你说的很有道理。我再试试,希望可以多多交流。。谢谢
4楼2016-08-18 17:02:26
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csutzk

木虫 (小有名气)


引用回帖:
2楼: Originally posted by MS_Z at 2016-08-18 16:28:27
同为novice,不知道回答能不能帮到你。你既然选择了NVT ensemble,那么这个体系的压力就是根据具体每一个时刻模拟体系内原子的动量等信息可以算出的。如果你还要添加压力的条件:那么这个模拟就变成NVTP,体系应该就 ...

在基本的setup task里面没有NPT  只有 NVT 和NVE……请问你用的什么版本
5楼2016-08-18 17:12:39
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csutzk

木虫 (小有名气)


引用回帖:
6楼: Originally posted by leebrave at 2016-08-18 18:02:28
首先,你要做一个盒子,三维周期性的,才能有npt的系综。
其次,你的温度设置的不够,才400k?  也就100摄氏度吖,怎们烧结?
最后,不太看好用同种的粒子烧结,没法分析分辨,最好用两种粒子。
还有,根据文献中 ...

朋友可以加个QQ么,太厉害!
7楼2016-08-18 18:23:27
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csutzk

木虫 (小有名气)


引用回帖:
7楼: Originally posted by csutzk at 2016-08-18 18:23:27
朋友可以加个QQ么,太厉害!...

设置400K是因为实验过程就是用的100摄氏度,主要是靠压力,三维盒子用什么来建呢?很感谢你的回复。
8楼2016-08-18 18:31:40
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MS_Z

金虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by csutzk at 2016-08-18 17:12:39
在基本的setup task里面没有NPT  只有 NVT 和NVE……请问你用的什么版本...

不存在NVPT这种ensemble。。。选项卡里当然没有。。,

发自小木虫IOS客户端
9楼2016-08-18 20:42:33
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leebrave

银虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
8楼: Originally posted by csutzk at 2016-08-18 18:31:40
设置400K是因为实验过程就是用的100摄氏度,主要是靠压力,三维盒子用什么来建呢?很感谢你的回复。...

在build选项卡中找到晶体一栏就可以的
不慌,平常心,一步一步走过来。
10楼2016-08-18 21:53:49
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