| 查看: 2850 | 回复: 9 | ||||
jiayoulongnv新虫 (著名写手)
|
[求助]
Error: Overlap matrix is not positive definite.怎么破？
|
|
Dmol3计算氧气分子在金属氧化物表面的结构优化计算中出错信息如下，是什么原因？怎么破？ Error: Overlap matrix is not positive definite. This most likely means the basis set contains linear dependencies. Consider increasing the atomic cutoff parameter or changing the basis set. 给出的建议中提到的atomic cutoff parameter是在哪里设置的？ |
回复此楼» 猜你喜欢
售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急
已经有3人回复
-
售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急
已经有4人回复
-
怎么看青基中了没有啊
已经有6人回复
-
国社科又开始会评了，不知道这次命运如何
已经有11人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急
已经有3人回复
-
售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急
已经有3人回复
-
有多少人是今天查系统知道结果的？
已经有19人回复
-
基金未中，这种答复是模板吗？
已经有7人回复
-
哪位高人中了，把查询到的截图贴出来让我看看，让我长长见识
已经有7人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
卡开发发
专家顾问 (著名写手)
Ab Initio Amateur
-
专家经验: +224 - 1ST强帖: 2
- 应助: 47 (小学生)
- 金币: 3567.8
- 散金: 14
- 红花: 223
- 帖子: 2477
- 在线: 1254小时
- 虫号: 1369423
- 注册: 2011-08-16
- 性别: GG
- 专业: 金属材料的磨损与磨蚀
- 管辖: 第一性原理
2楼2016-08-15 14:57:32
jiayoulongnv
新虫 (著名写手)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 4152.5
- 散金: 3924
- 红花: 7
- 帖子: 2319
- 在线: 375.1小时
- 虫号: 2326463
- 注册: 2013-03-07
- 性别: MM
- 专业: 敏感电子学与传感器
3楼2016-08-15 15:05:26
jiayoulongnv
新虫 (著名写手)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 4152.5
- 散金: 3924
- 红花: 7
- 帖子: 2319
- 在线: 375.1小时
- 虫号: 2326463
- 注册: 2013-03-07
- 性别: MM
- 专业: 敏感电子学与传感器
4楼2016-08-15 15:06:47
卡开发发
专家顾问 (著名写手)
Ab Initio Amateur
-
专家经验: +224 - 1ST强帖: 2
- 应助: 47 (小学生)
- 金币: 3567.8
- 散金: 14
- 红花: 223
- 帖子: 2477
- 在线: 1254小时
- 虫号: 1369423
- 注册: 2011-08-16
- 性别: GG
- 专业: 金属材料的磨损与磨蚀
- 管辖: 第一性原理
5楼2016-08-15 22:47:47
jiayoulongnv
新虫 (著名写手)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 4152.5
- 散金: 3924
- 红花: 7
- 帖子: 2319
- 在线: 375.1小时
- 虫号: 2326463
- 注册: 2013-03-07
- 性别: MM
- 专业: 敏感电子学与传感器
6楼2016-08-17 11:22:08
卡开发发
专家顾问 (著名写手)
Ab Initio Amateur
-
专家经验: +224 - 1ST强帖: 2
- 应助: 47 (小学生)
- 金币: 3567.8
- 散金: 14
- 红花: 223
- 帖子: 2477
- 在线: 1254小时
- 虫号: 1369423
- 注册: 2011-08-16
- 性别: GG
- 专业: 金属材料的磨损与磨蚀
- 管辖: 第一性原理
7楼2016-08-17 12:54:01
jiayoulongnv
新虫 (著名写手)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 4152.5
- 散金: 3924
- 红花: 7
- 帖子: 2319
- 在线: 375.1小时
- 虫号: 2326463
- 注册: 2013-03-07
- 性别: MM
- 专业: 敏感电子学与传感器
|
好的，你帮我看看 。另外，我想根据outmol文件里的能量信息来计算吸附能，应该是最终总能量和初始总能量做差，对吧？但是问题是，outmol文件中，最初总能量和最终总能量，怎么找到呢？ |
» 本帖附件资源列表
-
欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : SnO2_(1_1_0)_(O2_on_reduction_surface)_(2).outmol
- 附件 2 : SnO2_(1_1_0)_(O2_on_reduction_surface)_(2).xsd
2016-08-17 16:59:45, 995.56 K
2016-08-17 16:59:46, 506.39 K
8楼2016-08-17 17:01:26
jiayoulongnv
新虫 (著名写手)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 4152.5
- 散金: 3924
- 红花: 7
- 帖子: 2319
- 在线: 375.1小时
- 虫号: 2326463
- 注册: 2013-03-07
- 性别: MM
- 专业: 敏感电子学与传感器
9楼2016-08-17 17:04:39
卡开发发
专家顾问 (著名写手)
Ab Initio Amateur
-
专家经验: +224 - 1ST强帖: 2
- 应助: 47 (小学生)
- 金币: 3567.8
- 散金: 14
- 红花: 223
- 帖子: 2477
- 在线: 1254小时
- 虫号: 1369423
- 注册: 2011-08-16
- 性别: GG
- 专业: 金属材料的磨损与磨蚀
- 管辖: 第一性原理
|
问题比较多，我列在下面： 1、我不知道你的体系O2你现在的参数优化完是否O2在表面是非解离的状态，如果是的话，体系很有可能是三重态的，或者说磁矩为2，吸附的两个O上应当各自给一个单电子，这个在modify->electonic configuration中设置，我想这个可能是个主要的因素； 2、真空层不够高，DMol3的计算真空层对计算量贡献不大（与平面波完全不同），所以不要太吝啬； 3、体系使用的smearing有点大，一般0.003以下才可能有好的结果，得控制outmol中-kTeS，要足够小； 4、有条件的话Mulitipolar Expansion用Hex吧； 5、吸附能定义为E_ad=E_AB-E_A-EB。能量在total energy里面看，看最后一个。吸附能一般用更正或者更负来形容，严格来说，吸附能没啥确切的意义，得看吸附自由能，仅当熵变贡献不大的时候和吸附自由能才接近，或者，两个吸附体系进行比较的时候熵变贡献接近，仅仅比较能量才有点意义。 |
10楼2016-08-17 20:34:37
投票:
10