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观享世界

木虫 (小有名气)

[求助] 分子克隆问题

这张截图是我做的重组载体送去公司做的测序后在Pubmed上比对的结果,请问这个结果怎么样?我圈出来的那部分是什么情况?

分子克隆问题
截图.png
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书写人生
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2012continue

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

小c和大c没区别,-表示gap,也就是插入和缺失

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
2楼2016-08-22 19:54:51
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sang0065

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

第二个圈内容,为缺失
3楼2016-09-12 10:08:42
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didongwei

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

全是c的那个没问题,匹配成功就可以。但是第二个出现了碱基缺失,所以这个载体不能继续使用。载体构建过程中,如果测序结果出现碱基缺失或者碱基错配,载体都不能继续使用,但是同义突变除外(PS:也就是密码子第三个简并碱基出现错配,但是翻译出的氨基酸还是一样,载体仍可继续使用)
不是优秀,而是不可替代
4楼2016-09-13 08:56:03
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观享世界

木虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by didongwei at 2016-09-13 08:56:03
全是c的那个没问题,匹配成功就可以。但是第二个出现了碱基缺失,所以这个载体不能继续使用。载体构建过程中,如果测序结果出现碱基缺失或者碱基错配,载体都不能继续使用,但是同义突变除外(PS:也就是密码子第三 ...

那些显示碱基缺失或者多余的情况都是在最后面,一般都是到了最后面测序不准引起的吧?

发自小木虫Android客户端
书写人生
5楼2016-09-16 20:10:23
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didongwei

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by 观享世界 at 2016-09-16 20:10:23
那些显示碱基缺失或者多余的情况都是在最后面,一般都是到了最后面测序不准引起的吧?
...

嗯,有这个可能性,但是我以前在生工和华大测序,1000bp内基本没错配和缺失,尽管测序前告知的是750bp内无错配。

发自小木虫IOS客户端
不是优秀,而是不可替代
6楼2016-09-17 10:34:26
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