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观享世界

木虫 (小有名气)

[求助] 分子克隆问题

这张截图是我做的重组载体送去公司做的测序后在Pubmed上比对的结果，请问这个结果怎么样？我圈出来的那部分是什么情况？

分子克隆问题
截图.png
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书写人生
1楼 2016-08-11 12:03:48
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2012continue

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

小c和大c没区别，-表示gap，也就是插入和缺失

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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2楼2016-08-22 19:54:51
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sang0065

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

第二个圈内容，为缺失
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3楼2016-09-12 10:08:42
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didongwei

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

全是c的那个没问题，匹配成功就可以。但是第二个出现了碱基缺失，所以这个载体不能继续使用。载体构建过程中，如果测序结果出现碱基缺失或者碱基错配，载体都不能继续使用，但是同义突变除外（PS：也就是密码子第三个简并碱基出现错配，但是翻译出的氨基酸还是一样，载体仍可继续使用）
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不是优秀，而是不可替代
4楼2016-09-13 08:56:03
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观享世界

木虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by didongwei at 2016-09-13 08:56:03
全是c的那个没问题，匹配成功就可以。但是第二个出现了碱基缺失，所以这个载体不能继续使用。载体构建过程中，如果测序结果出现碱基缺失或者碱基错配，载体都不能继续使用，但是同义突变除外（PS：也就是密码子第三 ...

那些显示碱基缺失或者多余的情况都是在最后面，一般都是到了最后面测序不准引起的吧？

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书写人生
5楼2016-09-16 20:10:23
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didongwei

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by 观享世界 at 2016-09-16 20:10:23
那些显示碱基缺失或者多余的情况都是在最后面，一般都是到了最后面测序不准引起的吧？
...

嗯，有这个可能性，但是我以前在生工和华大测序，1000bp内基本没错配和缺失，尽管测序前告知的是750bp内无错配。

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不是优秀，而是不可替代
6楼2016-09-17 10:34:26
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