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子十月

新虫 (初入文坛)

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[求助] miRNA和靶基因的实时定量的问题已有1人参与

最近用相对定量的方法检测miRNA和靶基因的表达情况，遇到了一些很奇怪的现象，首先材料是两次生物学重复，四个处理，miRNA的趋势两个重复完全一致，与我前期的测序结果相同，可是预测的靶基因的表达情况两个样本完全是相反的，其中一个重复的miRNA和靶基因的表达情况是能完全对上的，可另外一个重复的miRNA和靶基因的表达情况完全对不上，我定量重复跑了好几遍，确定样品没弄错，定量结果也是可靠的，但这种情况该怎么去解释呢，是因为预测的靶基因都不正确吗？可是另外一个样品中是完全吻合的呀？这个问题困扰了我好久，希望好心的同学能帮忙解答一下，好人一生平安！谢谢！

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1楼 2016-08-09 16:30:12

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雨天下的犨

铜虫 (初入文坛)

应助: 3 (幼儿园)
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专业: 发育生物学

【答案】应助回帖

据我的理解，miRNA在组织细胞内负调控靶基因。这是miRNA发挥调控功能的主要机制。也因此给予人们miRNA应该与靶基因是此消彼长的表达模式。但要知道，miRNA可以调控多个靶基因，某一基因也可以受多个miRNA调控。高通列测序基于序列匹配，可以预测某一miRNA的靶基因。理论上，这一miRNA上调表达，靶基因下调表达。但该靶基因可能受多种调控作用，这一miRNA的负调控是次要的，这是就会发现两者表达模式对不上。以上仅是个人见解，望有用！