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子十月

新虫 (初入文坛)

[求助] miRNA和靶基因的实时定量的问题 已有1人参与

最近用相对定量的方法检测miRNA和靶基因的表达情况,遇到了一些很奇怪的现象,首先材料是两次生物学重复,四个处理,miRNA的趋势两个重复完全一致,与我前期的测序结果相同,可是预测的靶基因的表达情况两个样本完全是相反的,其中一个重复的miRNA和靶基因的表达情况是能完全对上的,可另外一个重复的miRNA和靶基因的表达情况完全对不上,我定量重复跑了好几遍,确定样品没弄错,定量结果也是可靠的,但这种情况该怎么去解释呢,是因为预测的靶基因都不正确吗?可是另外一个样品中是完全吻合的呀?这个问题困扰了我好久,希望好心的同学能帮忙解答一下,好人一生平安!谢谢!
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sevenwish

新虫 (小有名气)

2楼2016-08-17 11:20:26
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雨天下的犨

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

据我的理解,miRNA在组织细胞内负调控靶基因。这是miRNA发挥调控功能的主要机制。也因此给予人们miRNA应该与靶基因是此消彼长的表达模式。但要知道,miRNA可以调控多个靶基因,某一基因也可以受多个miRNA调控。高通列测序基于序列匹配,可以预测某一miRNA的靶基因。理论上,这一miRNA上调表达,靶基因下调表达。但该靶基因可能受多种调控作用,这一miRNA的负调控是次要的,这是就会发现两者表达模式对不上。以上仅是个人见解,望有用!
3楼2016-09-01 20:39:16
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