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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 【交流】Ubuntu 8.04 安装Sybyl7.3 的方法(共享)
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weishenme

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by xufund at 2008-11-19 12:11:
有谁在ubuntu8.0下安装过sybyl8.0的升级补丁？
麻烦给个升级步骤。谢谢！

8.0.3.08176那个吗？没在ubuntu下用过，我在RHEL5下直接装就可以，应该差不多吧。
先
export TA_ROOT=你sybyl安装目录
然后
chmod u+x Update-8.0.3.08176.sh
最后
./Update-8.0.3.08176.sh

第二步如果文件本身可执行的话就省了。

[ Last edited by weishenme on 2008-11-19 at 16:40 ]
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11楼2008-11-19 16:32:34
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lj623

金虫 (小有名气)
sybyl8.0升级补丁在哪?
另我已安装了蛋白数据库,同源模建还是不能用
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12楼2008-11-20 09:15:47
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xufund

至尊木虫 (知名作家)
引用回帖:
Originally posted by weishenme at 2008-11-19 16:32:

8.0.3.08176那个吗？没在ubuntu下用过，我在RHEL5下直接装就可以，应该差不多吧。
先
export TA_ROOT=你sybyl安装目录
然后
chmod u+x Update-8.0.3.08176.sh
最后
./Update-8.0.3.08176.sh

第二步如果 ...

"export TA_ROOT=你sybyl安装目录"是什么意思？是否就是用cd命令到sybyl安装目录？我把sybyl装到/home/wx/下了，出现两个文件夹一个是AdminTools10.8,里面有licsens文件，另一个文件夹里有sybyl的执行文件。请问我应该放到哪里？
第二步chmod u+x是什么意思？能解释一下吗？谢谢！
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13楼2008-11-20 20:05:15
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weishenme

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by xufund at 2008-11-20 20:05:

"export TA_ROOT=你sybyl安装目录"是什么意思？是否就是用cd命令到sybyl安装目录？我把sybyl装到/home/wx/下了，出现两个文件夹一个是AdminTools10.8,里面有licsens文件，另一个文件夹里有sybyl的执行 ...

这里假设你在补丁文件所在的目录。
export TA_ROOT=/home/wx/有sybyl的那个
这步定义环境变量，告诉系统你的sybyl装在哪儿，不是改变到你sybyl目录下。
chmod u+x 给文件的所有者加上执行权限，如果你下的文件本身就是有执行权限的这一步可以免了。

[ Last edited by weishenme on 2008-11-22 at 13:23 ]
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14楼2008-11-22 13:21:35
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lizzylee7557

LZ,linux系统才能装吗?
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15楼2009-01-01 17:12:39
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caixin5120

木虫 (正式写手)
sybyl 只能在 linux系统 和unix系统中用，当然你也可以安装虚拟机在window下用：）
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16楼2009-01-03 10:31:44
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dgq_81

木虫 (正式写手)
资源好像不能下了，能不能再传一下啊，
顶~~
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17楼2009-03-23 10:17:44
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caixin5120

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by caixin5120 at 2008-11-18 16:50:
回3楼的，我试过，ubuntu8.04 下面装的可以运行 surflex， 不过我的ubuntu8.04 装sybyl8.0 就老是有问题，安装文件老是安装不完全，导致无法启动8.0，因此这里我建议使用 redhat4 、5 的企业版系统，所有问题都不 ...

呵呵 谢谢兄弟的指点：） 对linux下面的shell 我也在学习 嘿嘿有机会多多交流啊！最近刚把autodock  的虚筛脚本弄明白：）

QQ：3530257
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18楼2009-06-14 00:16:00
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