24小时热门版块排行榜    

查看: 1248  |  回复: 17
当前主题已经存档。

caixin5120

木虫 (正式写手)


[交流] 【交流】Ubuntu 8.04 安装Sybyl7.3 的方法(共享)

Ubuntu 8.04 安装Sybyl7.3 的方法

第一步 安装Ubuntu8.04 做好linux系统的准备。

第二步 从新立得软件包管理器中安装Gmout-iso 软件 (虚拟光驱挂载软件)。

第三步 从新立得软件包管理器中安装搜索yum,选择yum和python-sqlitecachec,这两个软件安装;接下来搜索libmotif3,安装。 ------(此处是做好sybyl所需库的准备,以防后面报错。)

第四步 打开终端, $ sudo chomd 777 /usr/tmp/ ----给用户添加 /usr/tmp/文件夹的读写执行权限,这样就可以让用户直接安装sybyl7.3,不必要使用root超级用户了。

第五步 挂载iso虚拟光驱,打开 应用程序-系统工具-Gmout-iso,挂载你的sybyl7.3的第一张光盘。(以后的在安装过程中也用样的挂载光盘)

第六步 开始安装sybyl ,打开终端 $ /media/cdrom/install.sh ----执行sybyl的安装文件。
这个路径是我挂载光盘的位置,请根据自己的挂载光盘的位置来填写。

第七步 为sybyl找到license的来源,crack里面,设置sybyl的安装路径等,这里是窗口对话模式,自己填上就可以了,如同windows的软件安装一样。

Ok! 安装开始,完成第一张光盘后会提示你挂载第二张,第三张,第四张光盘。

最后的是启动,目前还是只能每次启动输入3个命令。

进入 AdminTools10.8/bin/linux 文件

$ cd /home/caixin/AdminTools10.8/bin/linux ----我放 AdminTools10.8的位置在/home/caixin
$ ./lmgrd triposlm
$ ./sybyl

当然你也可以做个软连接(相当于windows下的快捷方式)来启动。
$ ln /home/caixin/AdminTools10.8/bin/linux /home/caixin


到这里在Ubuntu8.04下sybyl7.3的安装就完成了。这是个人心得和安装方法,在自己摸索中总结出来的,希望能让初学者少走弯路,尽快接触sybyl7.3

声明:本文参考aspirin001作者的《ubuntu7.04下安装sybyl7.3》, 在此十分感谢aspirin001把自己的安装过程共享。我只是在这个基础上简化了安装过程,并指出不用安装python2.1,只需要yum和python-sqlitecachec就可以了。

PS:另外,如果是做分子对接的话,建议使用sybyl8.0的 surflex,效果比7.3有很大提高。:)

[ Last edited by zdhlover on 2009-11-15 at 13:34 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xufund

至尊木虫 (知名作家)

xie xie fen xiang
2楼2008-11-14 20:58:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

caixin5120

木虫 (正式写手)


:)呵呵 欢迎大家一起讨论 sybyl 的 使用哦,还有遇到的问题
3楼2008-11-14 21:13:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xufund

至尊木虫 (知名作家)

楼主。按照您的方法,我在ubuntu8.04下安装了sybyl8.0。但是无法运行surflex。其它几个对接程序也无法运行。请问您有这个问题吗?
4楼2008-11-17 21:29:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ky96998

金虫 (小有名气)

虚拟机上安装的SYBYL8.0的surflex模块等都能正常使用
5楼2008-11-18 00:51:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

weishenme

金虫 (小有名气)

“最后的是启动,目前还是只能每次启动输入3个命令。 “

自己写个脚本不就行了吗?
6楼2008-11-18 11:39:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

caixin5120

木虫 (正式写手)


呵呵 是可以写脚本的哈:) 不过我试过,好像有问题,必须先让 ./lmgrd triposlm 运行完成,才能运行接下来的语句。 所以也就差不多了
7楼2008-11-18 16:48:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

caixin5120

木虫 (正式写手)


回3楼的,我试过,ubuntu8.04 下面装的可以运行 surflex, 不过我的ubuntu8.04 装sybyl8.0 就老是有问题,安装文件老是安装不完全,导致无法启动8.0,因此这里我建议使用 redhat4 、5 的企业版系统,所有问题都不用担心了,安装很顺利。:)

祝你成功!
8楼2008-11-18 16:50:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

weishenme

金虫 (小有名气)

回7楼
怎么会不行呢?
你试试我写的看看。

#!/bin/bash
cd ~/sybyl8.0
/opt/tripos/AdminTools10.8/bin/linux/lmgrd triposlm
xterm -bg black -fg white -e /opt/tripos/sybyl8.0/bin/linux/sybyl &
export TA_ROOT=/opt/tripos/sybyl8.0
/opt/tripos/sybyl8.0/TriposBookshelf/tripostbs.sh -up &
exit 0

你根据你的修改一下试试看,第一行进入默认的工作目录,倒数二三行是为了开启bookshelf的检索功能。在桌面上建个图标,连命令都不用输了,呵呵。

[ Last edited by weishenme on 2008-11-18 at 21:05 ]
9楼2008-11-18 20:52:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xufund

至尊木虫 (知名作家)

有谁在ubuntu8.0下安装过sybyl8.0的升级补丁?
麻烦给个升级步骤。谢谢!
10楼2008-11-19 12:11:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 caixin5120 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 328求调剂,英语六级551,有科研经历 +3 生物工程调剂 2026-03-16 4/200 2026-03-16 20:13 by Wangjingyue
[考研] 304求调剂 +5 素年祭语 2026-03-15 5/250 2026-03-16 17:00 by 我的船我的海
[考研] 070303一志愿西北大学学硕310找调剂 +5 d如愿上岸 2026-03-12 8/400 2026-03-16 15:19 by peike
[考研] 070303 总分349求调剂 +3 LJY9966 2026-03-15 5/250 2026-03-16 14:24 by xwxstudy
[考研] 311求调剂 +6 冬十三 2026-03-15 6/300 2026-03-16 08:00 by wang_dand
[考研] 288求调剂 +4 奇点0314 2026-03-14 4/200 2026-03-14 23:04 by JourneyLucky
[考研] 265求调剂 +4 威化饼07 2026-03-12 4/200 2026-03-14 17:23 by userper
[考研] 复试调剂 +3 呼呼?~+123456 2026-03-14 3/150 2026-03-14 16:53 by WTUChen
[考研] 331求调剂(0703有机化学 +5 ZY-05 2026-03-13 6/300 2026-03-14 10:51 by Jy?
[考研] 312求调剂 +6 陌宸希 2026-03-10 6/300 2026-03-14 00:40 by JourneyLucky
[考研] 26调剂/材料/英一数二/总分289/已过A区线 +6 步川酷紫123 2026-03-13 6/300 2026-03-13 21:59 by 星空星月
[考研] 281求调剂 +9 Koxui 2026-03-12 11/550 2026-03-13 20:50 by Koxui
[考研] 材料与化工085600调剂求老师收留 +9 jiaanl 2026-03-11 9/450 2026-03-13 20:22 by JourneyLucky
[考研] 293求调剂 +3 世界首富 2026-03-11 3/150 2026-03-13 16:27 by JourneyLucky
[考研] 【0856】化学工程(085602)313 分,本科学科评估A类院校化学工程与工艺,诚求调剂 +7 小刘快快上岸 2026-03-11 7/350 2026-03-13 16:06 by ruiyingmiao
[考研] 307求调剂 +5 超级伊昂大王 2026-03-12 5/250 2026-03-13 15:56 by 棒棒球手
[考研] 工科材料085601 279求调剂 +8 困于星晨 2026-03-12 10/500 2026-03-13 15:42 by ms629
[考研] 277求调剂 +4 anchor17 2026-03-12 4/200 2026-03-13 11:15 by 白夜悠长
[考研] 材料专硕274一志愿陕西师范大学求调剂 +4 薛云鹏 2026-03-13 4/200 2026-03-13 10:40 by 学员8dgXkO
[考研] 296求调剂 +3 大口吃饭 身体健 2026-03-13 3/150 2026-03-13 10:31 by 学员8dgXkO
信息提示
请填处理意见